С конца 1980-х гг. была развернута серия малых ракетных кораблей на воздушной подушке со скегами проекта 1239. Головной корабль «Бора» был сдан флоту в 1989 г., второй-«Самум» в начале 1990-хгг. Корабли предназначались для закрытых морей — Чёрного и Балтийского и имели ограниченную автономность. Значительно уступая проекту 956 по водоизмещению, они имели значительную ударную мощь. Энергетическая установка довольно сложная — дизель-газотурбина общей мощностью 66 000 л.с. Она включает ГТД, которые через угловую редукторную передачу работают на два винта, размещенные на колонках и поднимающихся из воды при ходе под дизелями. Каждый из двух дизелей работает на свой винт. Для образования воздушной подушки используются два автономных дизель-нагнетательных агрегата. Полное водоизмещение корабля около 1000 т, размерения 64х 17,2 х 3,3 м, скорость хода 45 узлов, дальность плавания 2000 миль (при скорости хода 12 узлов), экипаж 60 человек. Вооружение: 2x4 ПКРК «Москит», ЗРК «Оса- МА1», 76-мм АУ АК-176 и 30-мм АУ АК-630.
По логике, должно было вестись проектирование малого противолодочного корабля для замены проекта 1124. За основу могла быть взята разработка проекта 1154 по состоянию на 1979 г. В предлагаемом виде водоизмещение 2000 т, размерения 96x12x3 м, скорость хода 30 узлов. Вооружение: 2x4 ПУ противолодочных ракет «Медведка», 3 ПУ ЗРК «Кинжал», 100-мм АУ А-190, 1x6 30 мм АУ АК-630. Такой тип корабля мог быть использован и пограничниками.
Продолжалось строительство ракетных катеров, базой для которых стал проект 1241Р. Начало их введения в строй относится к 1979 г. Получилась как бы универсальная база, на которой менялось только ракетное вооружение. Последняя серия проект 1242.1 с газотурбинной энергетической установкой. Полное водоизмещение 550 т, размерения 56,1x10,2x2,Зм, скорость хода 42 узла, автономность 10 сут, экипаж 40 человек. Вооружение: 2x2 ПКРК «Москит», 76-мм АУ АК-176, 2 30-мм АУ АК-630, ПЗРК «Игла» (12 ракет). На подходе уже была следующая модификация этого проекта с ПКРК «Оникс». Корабль должен был иметь 2 пакета ПУ по 4 ракеты и 1 100-мм АУ А-190.
В качестве дальнейшего развития и совершенствования снеговых кораблей велась разработка ракетного корабля на узких скегах «Стрепет» с водоизмещением 1000 т и с предполагаемой скоростью хода 100 узлов. Налицо был новый качественный скачок в этом направлении. До этого такую скорость смог развить только опытный корабль на подводных крылья «Смерч». Корабль был проработан в нескольких вариантах вооружения, в том числе и с 16 ПКР «Оникс». Для испытания новых принципов движения уже существовал корабль-макет СМ-0305. Он проходил испытания в 1982–1989 гг. и развивал скорость в 69 узлов. С принятием на вооружение сухопутного мобильного ракетного комплекса «Тополь» с 1986 г. разрабатывался и морской мобильный комплекс-носитель МБР «Тополь» на базе проекта 12321 «Джейран». Решалась проблема стабилизации корабля при запуске ракеты. Определялись места возможных запусков, места базирования. Решался ряд других проблем, связанных с неординарностью проекта. В конечном счёте от этого проекта отказались. Как было сказано в решении: «с достаточностью сухопутных мобильных комплексов», что, в общем-то верно, так как зона применения проекта 12321 была весьма ограничена. Но был изготовлен для испытаний корабль-макет.
Продолжается строительство разработанных специально для пограничных войск ФСБ России сторожевых кораблей проекта 10410. Обеспечивается применение оружия при волнении моря до пяти баллов на скорости до 22 узлов. При меньшем волнении — без ограничения скорости.
Большую часть десантных кораблей для Советского Союза строили на верфях Польши. Там же они и разрабатывались. С 1980 г. строилась вторая серия проекта 775.
В 1985 г. было выдано ТТЗ на разработку десантного корабля-дока. По результатам проработки Невским ПКБ было представлено 3 варианта, отличавшихся водоизмещением (от 19 500 до 24800 т), длиной (от 204 до 214 м) и размерами док-камеры (от 75 до 80 м). После обсуждения был выбран вариант для дальнейшей разработки, получивший номер проекта 1609. Водоизмещение 24 800/31 800 т, размерения 214 x41 м, размеры док-камеры 80x15x6 м. Вооружение: 130-мм АУ АК-130, 2 ЗРК «Кинжал», 4 ЗРАК «Кортик», 12 вертолётов Ка-29 (мог брать в перегруз 24 вертолёта), перевозимый десант -750 человек. В док-камере размещалось 3 десантных корабля проекта 1206 или 10 проекта 11770. Работы не вышли из предэскизного проектирования из-за ряда проблем, одной из которых был вопрос — где строить? А в начале 1990-х гг. было уже не до строительства десантных кораблей.
В нашей стране, кроме малых десантных кораблей, приоритет отдавался развитию десантных КВП. В серии находились крупные десантные КВП проекта 12322. Головной корабль был построен 1988 г. Большая дальность и скорость хода, всепогодность, возможность производить высадку десанта прямо на берег — вот основные достоинства этого проекта. Кроме того, корабль мог использоваться как минный постановщик, беря на борт до 80 мин. В серии находились также десантные КВП меньшего водоизмещения-проект 12061 «Мурена». Водоизмещение 132/149 т, размерения 31,6 х 14,8 м, общая мощность 4 ГТУ 40000 л.с., скорость 55 узлов, дальность плавания 200 миль при скорости 50 узлов с грузом 26 т, автономность 1 сут, экипаж 12 человек. Вооружение: 2x6 30-мм АУ АК-630, 2 гранатомёта «Пламя». Корабль мог брать на борт 1 танк или 2 БМП.
Параллельно с созданием полноотрывных амфибийных десантных КВП велась разработка более крупного десантного КВП со скегами проекта 1263 водоизмещением 2 500 т.
Из малых десантных кораблей в серии был хорошо себя зарекомендовавший проект 1176.
Продолжалось строительство всех видов тральщиков для нужд флота. Это морские тральщики проекта 12660, рейдовые тральщики проекта 10750, базовые тральщики проекта 1265 и малые — проекта 12255. На корпусе проекта 1155 разрабатывался эскадренный тральщик проекта 923 «Гранат» — носителя 5 вертолётов Ка-25ПМО. Водоизмещение 7200/7800 т, размерения 163x19x5,4 м, мощность ГТУ 53000л.с., скорость хода 30/18 узлов, дальность действия 5 600 миль (при скорости хода 14 узлов.), автономность 30 сут, экипаж 231 человек. Вооружение: 2 ЗРК «Кинжал» (64 ракеты), 2x1 100-мм АУ АК-100, 4x6 30-мм АУ АК-630, 1x2 25-мм АУ, АРПК «Удав-1».
Для управления зарождающимся огромным флотом, сбалансированным и мощным, требовались специальные корабли, разработкой которых и занималось Северное ПКБ. С 1972 г. разрабатывался эскадренный корабль радиолокационного дозора-вертолётоносец проекта 1077, он же штабной корабль. Стандартное водоизмещение 10000 т, размерения 186 x20 м, скорость 30 узлов, 4 вертолета Ка-27, 2 ПУ М-22 «Ураган», 100-мм АУ АК-100, 4 30-мм АУ АК-630, ЗРК «Оса-М». В 1977 г. появилась уже более совершенный проект 1077. Водоизмещение составило 10800/12910 т, размерения 202x22 м. На нём базировалось уже 6 вертолётов Ка-27. Предполагавшиеся в начале 6 ЗРК «Кинжал» были заменены на ЗРК «Форт». Вооружение: ЗРК «Кинжал», 130-мм АУ АК-130, 4 30-мм АУ АК-630, 2x5 533-мм ТА, РЛС «Фрегат-М» и «Подкат». По существу это были ракетные крейсера.
