Однако принадлежность к Наркомату авиационной промышленности не способствовала тесному взаимодействию НИИ-1, а затем и его филиала № 2 с заводами-производителями реактивных снарядов, относившимися к другому 'удельному княжеству' сталинского военно-промышленного комплекса — Наркомату боеприпасов.
Естественно, что принадлежность организации — разработчика реактивных снарядов к чужому ведомству в еще большей мере беспокоило как руководство Наркомата боеприпасов, так и заказчика — руководство Гвардейских минометных частей, командовавшее всеми вооруженными 'катюшами' частями и соединениями.
В силу ряда обстоятельств в руководстве этого вида войск все основные технические вопросы решались не их 'командиром', а 'комиссаром', т. е. членом военного совета Гвардейских минометных частей Львом Михайловичем Гайдуковым. Инженер по образованию, до войны — работник аппарата ЦК ВКП(б), он лучше других генералов владел техническими вопросами и обладал блестящими организационными способностями. Правда, звездный час его пробил несколько позже — по окончании войны он возглавил работы по освоению трофейной немецкой техники, стоял у истоков создания отечественного 'большого ракетостроения'. Да и дальнейшая его судьба складывалась достаточно удачно — в шестидесятые годы он достиг поста заместителя главнокомандующего Ракетными войсками по вооружению. Прожив долгую и плодотворную жизнь, он скончался в 2000 г., немного не дожив до девяностолетнего возраста.
Возвращаясь к военному времени отметим, что 13 марта 1944 г. Гайдуков представил Г. М. Маленкову как члену Государственного комитета обороны, курировавшему разработку новых образцов оружия и военной техники, проект постановления ГОКО о расширении работ по реактивному вооружению, предусматривающий, наряду с продолжением деятельности в данном направлении НИИРА и ЦАГИ, также создание в Наркомате боеприпасов новой организации — ОКБ для отработки и промышленного освоения новых образцов реактивных снарядов и совершенствования ранее созданных, а также организацию на заводе № 733 Наркомата минометного вооружения ('Компрессор') КБ по пусковым установкам.
Несколько позже, в октябре 1944 г., исходя из старого феодального принципа 'натурального хозяйства' нарком боеприпасов Борис Львович Ванников подготовил проект Постановления о создании в системе его наркомата ОКБ-3 для разработки реактивного вооружения, предусматривающий назначение его руководителем все того же Победоносцева. Однако предложения Гайдукова и Ванникова не получили поддержки, так как по сути дела предусматривали экспроприацию в пользу НКБ части НИИ-1 НКАП — как ценных кадров, так и территории.
Проблему надо было решать, опираясь на собственные силы. 16 марта 1945 г. Ванников обращается к заместителю председателя ГОКО Л.П. Берии с предложениями о создании новой проектно-конструкторской организации. Предложения по организации 'Центрального конструкторского бюро по реактивным снарядам № 1' мотивировались необходимостью совершенствования М-13, М- 13ДД, М-31, М-31УК, а также общим положением в ракетной технике. К этому времени появилась пусть и не вполне точная, но очень тревожная информация, указывающая на серьезное отставание от противника в области ракетной техники. В частности, согласно одному из сообщений, 'было установлено наличие у немцев образцов длиной до 14 м при диаметре до полуметра'.
Разместить новое КБ предлагалось в подмосковных Люберцах, на территории бывшего предприятия Наркомата боеприпасов, к тому времени занятой Главным артиллерийским управлением (ГАУ). На первых порах, до решения вопроса о возврате этой территории, новое ЦКБ можно было поселить на территории завода № 67. Этот завод, более известный как 'Мастяжарт' ('Мастерские тяжелой артиллерии'), организованный для военных нужд в 1916 г., после 'конверсии' начала двадцатых годов выпускал гражданскую продукцию, но с 1934 г. вернулся к оборонной тематике, постепенно полностью переключившись на выпуск авиабомб.
Предложения наркома получили поддержку. В соответствии с Постановлением ГКО от 19 апреля 1945 г. № 8206 'Об организации в системе наркомата боеприпасов конструкторского бюро и опытного завода по реактивным снарядам' Ванников 29 апреля 1945 г. приказом № 169 разместил новую организацию — ГЦКБ-1 — в корпусе № 5 на территории завода № 67. Однако всего через десять дней завершилась война с Германией и множество мобилизованных предприятий вернулись к выпуску мирной продукции. Завод № 67 оказался перегружен заказами, переданными ему от 'демобилизованных' предприятий… По согласованию с правительством Ванников разместил ГЦКБ-1 на территории завода № 775 Наркомата боеприпасов, на улице Верхней, поблизости от Белорусского вокзала столицы.
Постановлением Совнаркома от 7 января 1946 г. № 23 в порядке своего рода 'послевоенной демобилизации' наименований руководящих государственных органов Наркомат боеприпасов был преобразован в Наркомат сельскохозяйственного машиностроения с передачей ему также и ряда предприятий, в действительности связанных с обеспечением колхозов и совхозов вполне мирной техникой. Переименованное таким образом ведомство вскоре, 15 марта того же года, как и все наркоматы, стало именоваться министерством.
После окончания боевых действий неорганизованный вывоз и освоение трофейных образцов немецкой ракетной техники и документации, равно как и активизация аналогичных отечественных разработок привели к неоправданному параллелизму в работе организаций различных министерств и ведомств. Элементарный порядок был восстановлен после выхода важнейшего для развития отечественного ракетостроения Постановления Совета Министров СССР № 1017-419 от 13 мая 1946 г. по вопросам реактивного вооружения, определившего, в соответствии с п.6, Министерство сельскохозяйственного машиностроения (МСХМ) ответственным по разработке и производству реактивных снарядов с пороховыми двигателями.
'В целях выполнения возложенных на Министерства задач…' подпунктом 'б' п.9 Постановления предписывалось создать …'в Министерстве сельскохозяйственного машиностроения — Научно- исследовательский институт пороховых реактивных снарядов на базе ГЦКБ-1, Конструкторское Бюро на базе филиала № 2 НИИ- 1 Минавиапрома и Научно-исследовательский полигон реактивных снарядов на базе Софринского полигона'.
Ванников 18 мая 1946 г. издает приказ № 118, по которому, в соответствии с Постановлением, ГЦКБ-1 Минсельхозмаша впредь именуется НИИ-1. Преобразование филиала № 2 НИИ-1 Минавиапрома в КБ-2 Минсельхозмаша потребовало оформления совместного приказа двух министров от 24 мая за № № 213/123.
