Иван III собрал и доукомплектовал участвующие в операции отряды и направил их на штурм Казани. Однако ситуация на западных границах Руси изменилась не в лучшую сторону. Поэтому Иван III был вынужден принять предложение казанского хана начать мирные переговоры. Так был заключен мирный договор, по которому татары были обязаны освободить русских пленников, захваченных за последнее десятилетие. Договор был заключен 1469 году. Он продержался до февраля 1478 года.
Иван III за период с 1471 по 1478 год победил Новгородскую республику и присоединил ее к Московскому государству. Присоединил он и все колонии Великого Новгорода. Такой колонией была и Вятка, которую оккупировали казанские татары. Иван III требовал ее возвращения.
Время работало на русских. В боях с литовцами, татарами и др. закалялась армия. Численность армии достигла 150 тысяч человек.
В 1479 году умер казанский хан Ибрагим. Началась борьба за власть. Партия феодальной татарской верхушки, тяготевшая к Ногайской Орде, хотела видеть на ханском престоле царевича, сына Фатимы (жены Ибрагима) Али. Другая партия (прорусская) хотела сделать ханом Мухаммеда-Эмина, сына второй жены Ибрагима Нур-Султан. Сама Нур-Султан к тому времени стала женой крымского хана Менгли-Гирея. Самому Мухаммед-эмину было всего 10 лет. Его отправили в эмиграцию в Россию, где его благосклонно принял Иван III и позаботился о нем: дал ему в кормление и управление город Каширу. Это был личный удел царевича. Казанским ханом стал Али.
В 1484 году хан Али был низложен и на престол вступил Мухаммед-Эмин. Ему было 16 лет. Но он не справился со своей задачей, и ханом вновь стал Али. Как ни странно, Иван III старался стабилизировать положение в Казанском ханстве.
Но Иван III нисколько не забывал о главной государственной задаче – вернуть государству занятые русские земли. В 1487 году началось наступление русских войск на Казань. Казань была взята, хан и его семья пленены. Хана Али вместе с его женами отправили в ссылку в Вологду. Его мать Фатима и ее дети были сосланы в Белозерье, в городок Карголом.
Иван III не ликвидировал казанское ханство. Ханом был поставлен Мухаммед-Эмин. Но со средины 1487 года Москва перестала платить дань Казанскому ханству. Ногайская Орда и сибирское ханство готовы были рассматривать действия русских как агрессию, совершенно позабыв, как родилось Казанское ханство. Они пытались давить на Ивана III, требуя права свободного проезда через Московию для ногайских и сибирских купцов и освобождения казанских купцов от пошлин при торговле в России.
В период с 1487 по 1521 год Казанское ханство находилось под протекторатом России. Это значит, что Казань не должна была воевать против России. Выбор ханов на казанский престол должен был быть согласован с Россией. Казанские власти обязывались обеспечивать безопасность и неприкосновенность имущества русских купцов, а также безопасность всех русских подданных, которые проживали на территории Казанского ханства.
В 1495 году настроенная против России «восточная партия» вызвала в Казань войско сибирского царевича Мамука с тем, чтобы захватить власть, свергнув с престола хана Мухаммед-Эмина. В ответ на такое известие Иван III послал в Казань войско из Нижнего Новгорода. Но мятежники бежали из Казани и притормозили Мамука. Когда русские отряды вернулись из Казани, никого из мятежников там не обнаружив, Мамук со своим войском взял Казань и стал ханом Казанского ханства. Свергнутый хан Мухаммед-Эмин бежал в Москву.
Однако очень быстро новый хан в Казани и лидер «восточной партии» Кель-Ахмед не поладили. Хан был изгнан из Казани, а Кель-Ахмед обратился с извинениями к Ивану III. Была восстановлена прежняя власть, но ханом стал не Мухаммед-Эмин, а его брат Абдул-Лафит. Об этом просил Кель-Ахмед.
Однако попытки отдать Казанское ханство сибирякам на этом не прекратились. Казанский князь Урак призвал сибирских татар совершить в Казани переворот в пользу брата хана Мамука царевича Агалака. Но нападение сибирских татар было успешно отражено.
Лидер «восточной партии» князь Кель-Ахмед, по просьбе которого на ханский престол был посажен Абдул-Лафит, пожаловался Москве, что хан ведет антимосковскую политику. Поэтому он был низложен и отправлен в ссылку в г. Белоозеро. Ханом Казанского ханства вновь стал Мухаммед-Эмин.
Но Мухаммед-Эмин решил выйти из-под протектората Московского государства. Он в течение 1502 – 1505 годов готовился к войне с Россией. Историки пишут, что эта подготовка велась тайно. Трудно понять, как в течение трех лет можно было тайно создавать сильную армию и готовиться к войне. Сыграли, конечно, роль новые условия в России, и прежде всего старость Ивана III. В такой ситуации русские князья не думали о государстве, а заботились только о своих личных выгодах, полагая, что сильное, суверенное государство им не нужно. В очередной раз они забыли, что только в сильном государстве хорошо могут жить и князья и простой народ. Цель казанского хана была не только в том, чтобы стать самостоятельным, но и в том, как бы побольше заработать на продаже русских пленных в рабство. Так казанские правители понимали свои экономические приоритеты.
Войну татары начали как обычно: они перебили в Казани во время ежегодной Волжской ярмарки всех русских купцов, а их товарами завладели. Десятки тысяч русских мирных жителей (в том числе и послы) были объявлены пленниками. Казанское войско вместе с 20-тысячным войском Ногайской Орды направилось на Нижний Новгород. Но взять кремль в Нижнем Новгороде татары не смогли, хотя их было не менее 60 тысяч. Предводитель войска ногайский князь был убит, и всё войско вернулось в Казань. Обороной Нижнего Новгорода руководил воевода Иван Васильевич Хабар-Симский. Татары были выброшены за пределы Московского государства.
В 1505 году умер Иван III. Новый великий князь Василий IV предпринял попытку похода на Казань. Но она оказалась неудачной. В 1507 году был подписан мирный договор между Москвой и Казанью. По договору устанавливался «мир по старине и дружбе, как было с великим князем Иваном Васильевичем» (т. е. при Иване III).
Василий IV хорошо знал вероломство татар. Он предпринял меры по укреплению обороноспособности страны. В Нижнем Новгороде была сооружена новая каменная крепость на современном уровне фортификационных достижений XVI века.
В 1512 году был подписан договор о «вечном мире». Срок действия договора – «доколе Бог даст».
Хан Мухаммед-Эмин в 1516 году тяжело заболел. Казань просила Москву отпустить на ханство Абдул- Лафита. Но Москва Казани отказала. Условия проживания Абдул-Лафита были существенно улучшены – ему дали в «коромление» г. Каширу. Однако в 1517 году он скоропостижно умер. В 1518 году в Казани скончался и его брат хан Мухаммед-Эмин. Оба они были бездетными, и династия Улуг-Мухаммеда на этом прервалась.
Взоры Казани обратились в сторону Крыма – там проживали родственники казанской династии. Это были сыновья крымского хана Менгли-Гирея. За этого хана вышла замуж казанская ханша Нур-Султан, мать Абдул-Лафита. Остановились на кандидатуре сводного брата Абдул-Лафита и Мухаммеда-Эмина. Его звали