Введение эстонского «Омакайтсе» в подчинение командиру полиции порядка изменило положение в части Сааремаа. Возникла необходимость сформировать там снова «Омакайтсе». Для разрешения местного положения и предварительных работ к формированию на место выехал руководитель полиции и «Омакайтсе» подполковник Э. Рейсаар, который находился в Куресааре с 18 до 20 февраля 1942 г. После того, как формирование снова определенно было закончено, руководителем «Омакайтсе» Сааремаа был назначен капитан Петер Кангро из штаба «Омакайтсе» Таллин-Нымме, Капитан П. Кангро приступил начиная с 25 февраля к исполнению своих обязанностей, и с того срока можно считать начало снова формирования «Омакайтсе». К 11 марта успели с работами по формированию так далеко, что «Омакайтсе» приняло охраняемые объекты и приступило к несению караульной службы.
Также и вторичное формирование «Омакайтсе» Сааремаа началось, т<ак> сказать, «голыми руками», так как имущество ликвидированного «Омакайтсе» было в промежуточный срок передано в распоряжение других учреждений. С приветливым содействием коменданта были преодолены многие трудности. Оружие и боеприпасы для самых острых необходимостей были получены по распоряжению командира полиции порядка от охранного батальона. Вскоре были преодолены крупнейшие трудности и деятельность «Омакайтсе» развивалась успешно.
В январе 1942 г. поднялся в акутном виде вопрос о закрытии бывшей восточной границы Эстонии, для чего предполагалось формировать зарплатные части «Омакайтсе». Начиная с 20 ноября 1941 г. исполнял задачи по закрытию границы на западном берегу Псковского озера от бывшей эстонско-русской границы до Выыпсу отдельный батальон из «Омакайтсе» Петсери. По западному и северному берегам озера Пейпси и на линии реки Нарва исполняли эти задачи в большинстве части «Омакайтсе», которые были пополнены командой охранного батальона и двух рот вспомогательной полиции Нарвы.
21 января 1942 г. были утверждены директором внутренних дел штаты управления пограничной «Омакайтсе» и четырех отдельных батальонов пограничной «Омакайтсе». Поименованные штаты вступили в силу начиная с 1 февраля 1942 г., с какого времени и началось комплектование управления пограничной «Омакайтсе». С этого же времени переименовали Отдельные батальоны «Омакайтсе» из Нарвы, Тарту и Петсери по порядку в 1-й, 2-й и 3-й отдельные батальоны пограничной «Омакайтсе», а 2-й отдельный батальон «Омакайтсе» Тарту — в 4-й отдельный батальон пограничной «Омакайтсе».
Управление пограничного «Омакайтсе» было укомплектовано из офицеров бывшей эстонской пограничной стражи. Руководитель — полковник И. Пауль, заместитель руководителя — подполковник А. Вийлип, начальники отделений: капитан А. Вытинг и капитан И. Тали, адъютант лейтенант П. Аукси. Командиром 1-го отдельного батальона был назначен майор Э. Кукесте, командиром 2-го отдельного батальона — майор П. Пладо и командиром 3-го батальона — подполковник И. Лабидас.
Управление пограничного «Омакайтсе» и четыре отдельных батальона пограничной «Омакайтсе» входили в состав Управления полиции и «Омакайтсе», а руководитель пограничного «Омакайтсе» был в непосредственном подчинении руководителя полиции и «Омакайтсе». В первую очередь подлежали укомплектованию 1-й, 2-й и 3-й отдельные батальоны пограничного «Омакайтсе». Начиная с 1 марта 1942 г. подчинили 2-й и 3-й отдельные батальоны руководителю пограничного «Омакайтсе», между тем как 1-й остался в непосредственном подчинении руководителю «Омакайтсе» Нарва, а 4-й — руководителю «Омакайтсе» Тартумаа. Последний вообще не выполнял задач по охране границы, а был снаряжен на несение караульной службы в городе Тарту.
К апрелю мес<яцу> 1942 г. пограничное «Омакайтсе» закрывало бывшую восточную границу Эстонии от южного берега Псковского озера, бывшей границы Эстонии-России, до Нарвского залива, каковое расстояние было разделено на три участка охраны — участки охраны 1-го, 2-го и 3-го отдельных батальонов пограничного «Ома-кайтсе». Всего были к началу апреля месяца снаряжены на службу по закрытию границы 39 кордонов (постов) с 477 человеками (состав команды 15 апреля). На участке 1-го отдельного батальона пограничного «Омакайтсе» в закрытии границы помогало пограничному «Омакайтсе» — «Омакайтсе» Нарвы посредством своих постоянных караульных постов на Эстонско-Российской границе. Позднее и на этом участке выпала главная тяжесть закрытия границы на пограничное «Омакайтсе», где, например, 12 июня было в действии 15 кордонов с 94 человеками.
Пограничное «Омакайтсе» было укомплектовано одними лишь зарплатными командами.
Согласно приказу командира полиции порядка подполковника Шаллерта от 10 апреля 1942 г. началось переустройство службы по закрытию границы, причем, эти обязанности перешли на немецкую таможенно- пограничную охрану, которая на добровольных началах перевела к себе и часть команды пограничного «Омакайтсе». Всего перешло 74 человека. Начиная с 22 апреля 1942 г. закончили свою службу по закрытию границы 2-й и 3-й отдельные батальоны. 1-й батальон продолжал службу до 6 августа, с какого срока батальон считался ликвидированным, а сформированная из батальона 1-я казармированная рота «Омакайтсе» осталась в распоряжении руководителя «Омакайтсе» Нарвы для продолжения службы по закрытию границы.
2-й и 3-й отдельные батальоны пограничного «Омакайтсе» были ликвидированы считая с 1 мая 1942 г., причем большая часть команды была переведена в 4-й отдельный батальон, который позднее был переименован в батальон «Омакайтсе» Тартумаа.
Управление пограничного «Омакайтсе» закончило свою деятельность 3 июля 1942 г. Штаты, как управления, так и отдельных батальонов, были исключены из штатов Управления полиции и «Омакайтсе» считая с 6 августа 1942 г.
В течение своей деятельности пограничное «Омакайтсе» задержало и передало в распоряжение полиции за переход границы без разрешения при переходе из России в Эстонию в 46 случаях 127 лиц, а при переходе из Эстонии в Россию в 8 случаях 23 лица
В то же самое время поймали при попытке перейти без разрешения границу и отправили от границы обратно при переходе из России в Эстонию 1 681 лицо и при переходе из Эстонии в Россию 1101 лицо.
За спекуляцию через границу задержано и передано в распоряжение полиции на пути из Эстонии в Россию в 25 случаях 48 лиц, а на пути из России в Эстонию в 6 случаях 9 лиц. Подозреваемых в спекуляции задержано в районе границы и передано в распоряжение полиции в 55 случаях 82 лица. Приготовление самогонного вина и спекуляция им в районе границы обнаружено в 22 случаях при 27 лицах. В одном случае, проведенном при поддержке «Омакайтсе» <пре>следовании, задержан 1 парашютист, а 2 были убиты во взаимной перестрелке. Явившихся в район границы бежавших русских военнопленных задержано 9. У лиц, задержанных за спекуляцию, отняты, как объекты и транспортные средства, очень разнообразные вещи и материалы, главным образом съестные продукты и текстильные вещи. Съестные продукты менялись в России на одежду и другие материалы, как: соль, керосин, сено, семя от травы и т. п. Например, у одного спекулянта было найдено всего 3600 кг ржи, более 2100 кг ржаной муки, более 1400 кг свинины, более 290 кг говядины, 2321 кг лука, 207 кг соли, 191 кг табаку, 65 литров самогонного вина, 43 литра керосина, 17 поросят и т. д. В качестве транспортных средств взято в распоряжение полиции 44 лошади с упряжью и санями.
Пограничное «Омакайтсе» со своей кратковременной деятельностью, которая в начале при малочисленности и необученно команды не была особенно влиятельною, было достойным упоминания фактором, чтобы препятствовать голодавшей массе России попасть в Эстонию и отсюда вывезти съестные продукты.
21 января 1942 г. директором внутренних дел были утверждены и, считая с 1 марта, им же признаны действующими штаты Управления полиции и «Омакайтсе», а также штаты «Омакайтсе». Вместо прежних инспектур, Управление полиции и «Омакайтсе» разделилось на отделы, а последние на отделения. Руководством и делопроизводством «Омакайтсе» занимались три отдела: 1 отдел (общий), 2 отдел (снабжения) и 3 отдел (руководство). В названных трех отделах были отделения: в 1 отделе — отделение «А» (личный состав), отделение «Б» (общее делопроизводство), отделение «С»(Ц) (кодификация), отделение «Д» (история). Во 2 отделе: отделение «А» (общее), отделение «Б» (денежн<ой> отчетн<ости>), отделение «С» (Ц) (интенданту-ра), отделение «Д» (оруж<ейно>- технич<еское>), отделение «Е» (Э) (санитарное). В 3 отделе: отделение «А» (руководство), отделение «Б» (обучения), отделение «С» (Ц) (организация и штаты). За исключением отделения «Е» 2 отдела, все отделения были укомплектованы.
