В ходе серийного производства предпринимались попытки оснастить самолет более мощной силовой установкой. В результате появился вариант Fw189E, именуемый «быстрым Fw 189». На этом самолете применили французские моторы воздушного охлаждения GR-14M04/05 - двухрядные малогабаритные 14- цилиндровые -звезды» взлетной мощностью по 700 л.с. Адаптацию конструкции разведчика под новые движки выполнила французская фирма SNCASO из Шатьлон-сюр-Сена. В прототип переоборудовали серийный Fw189A-1 (Wr.Nr. 0090), который получил обозначение Fw 189V14. Судьба самолета оказалась недолгой, после завершения заводских испытаний при перегонке в Германию он разбился у г. Нанси. В серию Fw 189Е так и не попал.
Еще одной попыткой увеличить энерговооруженность разведчика стала модификация Fw189F-1. На этой машине (прототип Fw 189V15 переоборудовали из серийного Fw 189А-2) установили моторы «Аргус» As 411МА-1, представлявшие собой развитие As 410 с другим редуктором, благодаря чему взлетную мощность удалось поднять до 580 л.с. Модификация Fw 189F-1 стала последним серийным вариантом - в начале 1944 г. завод в Мериньяне изготовил 17 таких самолетов.
Не попала в серию модификация Fw189F-2 с улучшенной бронезащитой и топливными баками увеличенной емкости, а также электрическим вместо гидравлического приводом уборки шасси. Шасси с электроприводом отрабатывалось на опытных самолетах Fw 189V10 и V11 (Wr.Nr. 0047 и 0048).
На бумаге остался вариант Fw 189G который предполагалось оборудовать еще более мощными моторами «Аргус» As 402, развивавшими на взлете 950 л.с. Согласно расчетам, максимальная скорость Fw 189G на высоте 4500 м должна была достичь 435 км/ч. Но ввиду проблем с доводкой мотора, программу создания Fw189G закрыли.
Подобно многим другим самолетам, Fw189 дорабатывали для решения специфических задач. Среди подобных переделок, осуществляемых в ремонтных мастерских, следует отметить ночной истребительный вариант, предназначенный для перехвата легких тихоходных самолетов типа У-2. Первые такие машины появились в начале 1944 г. При переоборудовании Fw 89А получал в носовой части гондолы радиолокатор FuG-212 «Лихтенштейн С-1» с характерной антенной, а в центральной части - 15-мм пушку MG151/15 фирмы Mauser в установке «Шраге музик» для стрельбы вперед-вверх, которую монтировали на месте верхнего пулемета. Для обеспечения светомаскировки на выхлопные патрубки двигателей устанавливали пламегасители. С самолета снимали все разведоборудование, экипаж был сокращен до двух человек. Благодаря этому, взлетную массу машины удалось удержать в приемлемых пределах, несмотря на применение довольно массивного радиолокатора. Как ни удивительно, но специального буквенного обозначения эта модификация не получила. Считается, что всего в истребительный вариант было переоборудовано порядка трех десятков Fw 189А.
В общей сложности было построено 864 Fw 189. Это количество меркнет на фоне тысяч самолетов других типов, поставленных люфтваффе во время Второй мировой войны. Тем не менее, самолеты- разведчики «Фокке-Вульф» сыграли исключительно важную роль в боях.
Освоение новых самолетов в люфтваффе, согласно установившейся практике, начиналось в инструкторских эскадрах. Не стал исключением и Fw 189. Уже в конце 1939 г. первые учебные машины Fw 189В были переданы в 9-й (ближнеразведыва-тельный) отряд 2-й инструкторской эскадры (9.(H)/LG2). Осенью 1940 г. эта же часть получила Fw 189А-0. Но поставки новых разведывательных самолетов, не относившихся в тот период к приоритетам люфтваффе, разворачивались медленно. В ходе Балканской кампании весной 1941 г. и начального этапа войны против СССР ближнеразведывательные авиаподразделения продолжали летать на старых машинах. Как ни странно, но в ноябре 1941 г. первым из строевых частей получил новые Fw189A дальнеразведывательный отряд 2.(F)/11, эксплуатировавший их вместе с несколькими Do 17. Вслед за ним разведчики фирмы «Фокке-Вульф» поступили в отряд 1,(Н)/31, приданный 8-му армейскому корпусу, и в 3.(Н)/32, взаимодействовавший с 12-й танковой дивизией
По состоянию на 1 марта 1942 г. оба ближнеразведывательных отряда, входивших в состав 1-го воздушного флота (группа армий «Север») - 1 .(H)/AufklGr 13 и 4.(H)/AufklGr23 - все еще летали на «Хеншелях». Фактически той весной только началось массовое перевооружение отрядов ближней разведки. В 4-м ВФ (группа армий «Юг») лишь один отряд - 1 .(Н)/ AufklGr 41, дислоцировавшийся в Красно-граде под Харьковом, был вооружен Fw 189А (5 машин), остальные семь летали на Hs 126. Немного лучше ситуация складывалась в 6-м ВФ (группа армий «Центр»). Из пятнадцати ближнеразведывательных отрядов этого воздушного флота на новые самолеты были перевооружены семь, в которых в общей сложности насчитывался 31 Fw189A. Еще пять летали на Hs 126, а три не имели материальной части вообще! Наконец, в составе 3-го ВФ на территории Германии, Франции и Нидерландов находились 13 ближнеразведывательных отрядов. Все они в октябре 1941 - феврале 1942 гг. были отведены в тыл для отдыха и переучивания на Fw189A. В их составе числились 68 новых разведчиков. По мере их освоения эти отряды возвращались на Восточный фронт. В частности, уже в апреле 1942 г. на аэродром Белый в состав 6-го ВФ прибыл 1.(Н)/ AufklGr 11. Следом за ним вернули на фронт 3.(H)/AufklGr 12. В мае в Брянск (6-й ВФ) прибыл 2.(Н)/ AufklGr 13, а в Купянск (4-й ВФ) - недоукомплектованный 5.(Н)/ AufklGr 11. В Керчи состав 4-го ВФ пополнил 4.(H)/AufklGr31. Сразу шесть отрядов, вооруженных Fw189A, прибыли на оккупированную территорию СССР в июне 1942 г. В частности, 6-й воздушный флот получил отряд 2.(H)/AufklGr31, перелетевший в Курск, - единственную часть, которая еще не «отметилась» на Восточном фронте (в июне 1941 г. ее отвели на перевооружение из Греции). Туда же прибыл и 2.(Н)/ AufklGr 32. Интересно, что в составе этого отряда, наряду с Fw 189А-1, числился и один самолет серии А-0. 4-й ВФ получил 1. (H)/AufklGr 10 (Купянск), 5.(H)/AufklGr 12 (Полтава) и 1 .(H)/AufklGr 21 (Артемовск), а также 1 .(H)/AufklGr 12, место дислокации которого установить не удалось. Наконец, в июле 6-й ВФ получил 6.(H)/AufklGr 13 (авиабаза Фролов).
Таким образом, в течение весны-лета 1942 г. ближнеразведывательные части Восточного фронта были в основном перевооружены на Fw 189А - по состоянию на 1 сентября в их составе числилось 174 таких самолета, против 103 Hs126. Очень небольшое количество Fw189A попало в Северную Африку. Здесь на них летал единственный отряд 4.(H)/AufklGr 12.
Массовое поступление Fw189A во фронтовые части совпало по времени с реорганизацией разведывательной авиации. В апреле 1942 г. была учреждена должность «генерала от разведчиков» - General der Aufklarungsfbeger, т.е. командующего разведывательной авиацией. Первоначально этот пост занял генерал-лейтенант Гюнтер Лохмами (Gunther Lohmann), служивший воздушным наблюдателем еще в кайзеровской авиации. В ноябре 1942 г. его сменил генерал Карл Хеннинг фон Барсевищ (Karl Henning von Barsewitz), бывший инициатором и идеологом реформирования разведывательной авиации.