Сентябрь — возобновил чтение лекций в университете, начал преподавать во Втором кадетском корпусе, Николаевском инженерном училище и Институте корпуса инженеров путей сообщения и заведовать в последнем химической лабораторией.
Декабрь — с закрытием университета после студенческих сходок Менделеев в числе многих других преподавателей выведен за штат. Поездка на завод в Кошелях (близ Боровичей) для усовершенствования технологии перегонки древесной смолы. Рождение Агнессой Фойхтман дочери Розамунды.
1862, январь — март — чтение публичных лекций в здании Петербургской городской думы.
5 апреля — присуждение учебнику «Органическая химия» полной Демидовской премии.
29 апреля — венчание с Феозвой Никитичной Лещовой.
6 мая — выезд с женой в четырехмесячную командировку в Европу. Июнь — посетил Всемирную выставку в Лондоне.
6 августа — смерть старшего брата Ивана.
Конец декабря — взял на воспитание племянника Якова.
1863, март — рождение дочери Марии.
20 марта — начал исследование плотности спиртов и спиртоводных растворов.
20 августа — выехал по предложению нефтезаводчика В. А. Кокорева на Бакинские промыслы для экспертизы методов переработки и транспортировки нефти.
1 сентября — смерть дочери Марии.
9 октября — возвратился в Петербург.
1864, 1 января — утвержден в должности профессора химии Технологического института и штатного доцента Петербургского университета.
9 мая — середина августа — путешествовал с женой по Европе, лечился на австрийском курорте Ишль.
1865, 2 января — рождение сына Владимира.
31 января — защитил докторскую диссертацию «Рассуждение о соединении спирта с водою».
24 апреля — утвержден экстраординарным профессором Петербургского университета по кафедре технической химии.
14 июня — совместно с Н. П. Ильиным приобрел имение Боблово.
7 декабря — утвержден ординарным профессором.
9 декабря — избран членом Вольного экономического общества.
1866, 21 апреля — на чрезвычайном общем собрании Вольного экономического общества одобрена предложенная Менделеевым программа сельскохозяйственных опытов.
Октябрь — начал работать в комиссии по подготовке к участию России во Всемирной Парижской выставке 1867 года.
Ноябрь — переехал с семьей на университетскую квартиру.
1867, февраль — май — посетил Всемирную выставку в Париже.
Сентябрь — завершил книгу «О современном развитии некоторых химических производств в применении к России и по поводу Всемирной выставки 1867 года».
18 октября — перешел на кафедру общей химии Петербургского университета.
22 декабря — назначен членом Медицинского совета Министерства внутренних дел.
1868, 15 февраля — собрание членов-учредителей Русского химического общества приняло проект устава, составленного Менделеевым.
Конец мая — начало июня — вышел в свет первый выпуск первой части «Основ химии».
Конец декабря — осматривал молочные хозяйства в Тверской губернии.
1869, 17 февраля — составил таблицу «Опыт системы элементов, основанной на их атомном весе и химическом сродстве».
1870, 28 марта — выступил в качестве эксперта на процессе об убийстве фон Зона.
29 ноября — окончил статью «Естественная система элементов и применение ее к указанию свойств неоткрытых элементов».
1871, конец февраля — вышел в свет последний выпуск первого издания «Основ химии».
Май — июнь — научная командировка в Европу.
Конец декабря — начал исследование упругости газов.
1872, 21 марта — первое заседание созданной по инициативе Менделеева Комиссии по исследованию свойств газов при Русском техническом обществе.
17 июня — начало августа — поездка за границу для приобретения оборудования для работы с газами.
13 сентября — уход из Технологического института.
1873 — начал экспериментальные исследования свойств газов при разном давлении.
1874, 29 октября — на заседании физико-математического отделения Академии наук кандидатура Менделеева в адъюнкты отвергнута по формальной причине отсутствия вакансии.
1875, февраль — встреча с французским писателем и историком Э. Ренаном.
Март — завершил первую часть «Отчета об упругости газов».
7 мая — первое заседание созданной по инициативе Менделеева комиссии для рассмотрения медиумических явлений.
15 декабря — чтение первой публичной лекции о спиритизме.
Декабрь — доклад Ж. Б. Дюма о работе Д. И. Менделеева «О температуре верхних слоев атмосферы» на заседании Парижской академии наук.
1876, 8 января — выступил с предложением об объединении Русского химического и Русского физического обществ.
5 марта — в «Московских ведомостях» вышла статья с грубыми нападками на Менделеева в связи с его выступлениями в защиту устава университета.
Апрель — чтение двух публичных лекций о спиритизме.
18 мая — конец июля — командировка в США для изучения нефтяной отрасли и посещения Всемирной выставки в Филадельфии.
29 декабря — избран членом-корреспондентом Петербургской академии наук.
1877, январь — опубликовал книгу «Нефтяная промышленность в Северо- Американском штате Пенсильвания и на Кавказе».
Май — познакомился с подругой племянницы Анной Поповой.
Лето — фактически прекратил исследование упругости газов.
1878, 17 сентября — поездка за границу для лечения и сбора материалов по вопросам воздухоплавания.
1879, конец мая — возвратился в Россию.
1880, май — июнь — посетил кавказские нефтепромыслы.
11 ноября — кандидатура Менделеева в члены Петербургской академии наук забаллотирована.