В связи с тем, что значительная часть личного состава 1-й эскадрильи была откомандирована в 63-й ОАО, возникла необходимость пополнения эскадрильи из других подразделений. Поэтому, в феврале-апреле 1971 г. было организовано повторное теоретическое переучивание на самолет МиГ-25Р на новой учебной базе полка. 16 июля 1971 г. за успехи в освоении новой авиационной техники девять офицеров полка награждены орденами и медалями: гв. майор Н.П. Чудин – орденом Красного Знамени, гв. майор И.М. Мирошниченко, гв. капитаны Ю.В. Марченко, В.Н. Маштаков, Н.П. Борщев, А.И. Яшин – орденами Красной Звезды; гв. капитан Н.А. Левченко, гв. капитан технической службы И.Х. Бутаев и гв. старший лейтенант технической службы А.К. Трунов медалью «За боевые заслуги».
22 июля 1971 г. при выполнении полета на воздушную разведку в стратосфере из-за отказа в системе энергоснабжения самолета по причине конструкторско-производственного дефекта произошла авария МиГ- 25Р (№«42»), который пилотировал гв. капитан Е.Старовойтов, а 6 октября этого же года из-за падения тяги двигателей на взлете произошла катастрофа самолета Як-27Р в которой погиб экипаж заместителя командира 2-й эскадрильи гв. капитана В.М. Анисимова и заместителя штурмана эскадрильи гв. старшего лейтенанта B.C. Колосенко.
К концу 1971 г. полк получил с завода первую спарку МиГ-25РУ, но новые боевые МиГ-25Р почти не поступали: за год пришло всего четыре самолета. На 1 января 1972 г. самолетный парк полка составляли 23 разведчика Як-27Р, пять спарок Як-28У, четыре МиГ-25Р, один МиГ-25РУ и один связной Ан-2. В 1972 г. полк налетал 3172 ч, из которых налет на МиГ-25 составил 402 ч. В апреле 1 -я АЭ на самолетах МиГ-25Р/РБ (МиГ-25РБ поступили в полк в январе 1972 г.) с 11 по 21 апреля принимала участие в учениях «Весна-72» по плану ГШ ВВС.
3-я эскадрилья с 20 июня по 25 августа 1972 г. в полном составе участвовала в ликвидации лесных пожаров в Московской, Владимирской, Горьковской и Смоленской областей. Командующий ВВС МВО объявил всему личному составу эскадрильи благодарность, а три военнослужащих награждены медалью «За отвагу на пожаре». Лето того года выдалось очень жарким и сухим, и к августу от пожаров уже страдали леса и торфянники в Московской, Ярославской Калининской и Брянской областях, контроль за возникновением очагов лесных пожаров был затруднен. Командованием МВО было принято решение о проведении операции «Лес», в ходе которой экипажи 47-го ОГРАП выполняли вылеты на воздушную разведку по выявлению очагов пожаров. При этом экипажи 2-й и 3-й эскадрилий с аэродрома Дягилево (Рязань), а 1-й эскадрильи с аэродрома Шаталово, выполнили в период с 8 августа по 17 сентября 278 самолето-вылетов на воздушное фотографирование. Аэрофотографическая служба полка проявила 6725 м аэрофотопленки, отпечатала 5575 снимков, изготовила для ГШ ВВС и командования МВО 450 фотосхем.
С 20 сентября к переучиванию на МиГ-25РБ приступила 2-я эскадрилья, в связи с этим изменился количественный состав авиационной техники. На 2 октября в полку имелось уже 14 МиГ-25РРБ, четыре МиГ-25РУ, 18 Як-27Р и четыре Як-28У.
1973 г. выдался одним из самых напряженных в послевоенной истории полка. За год полк налетал 3092 ч, из которых: 1529 – на МиГ-25, 1336 – на Як-27Р и Як-28У, 225 – на Ан-2. Основной задачей первого полугодия была подготовка и участие в учениях «Украина» по плану МО СССР и продолжение переучивания летчиков 2-й эскадрильи на МиГ-25РБ. С мая по октябрь аэродром Шаталово был закрыт на профилактический ремонт, и полк всем составом базировался в Шайковке. Самую важную задачу предстояло решать во втором полугодии: с июня по август нужно было провести войсковые испытания самолета МиГ-25РБ.
С 29 мая по июня полк составом 1-й (десять МиГ-25РБ и один МиГ-25РУ) и 3-й (восемь Як-27Р и один Як-28У) эскадрилий, взлетев по тревоге, перебазировался в Полтаву, откуда принимал участие в учениях «Украина». Одно звено (четыре Як-27Р) 3-й эскадрильи с 20 по 23 июня на полигоне «Гороховец» участвовало во взаимодействии с танковым полком в показных учениях для слушателей военных академий. С этой целью звено было перебазировано на аэродром Правдинск.
В июне 1-я эскадрилья приступила к проведению войсковых испытаний МиГ-25РБ. Для этого было отобрано десять лидерных самолетов из числа наиболее новых (последних серий), только недавно поступивших с завода и десять наиболее подготовленных летчиков. Возглавил летную группу заместитель командира полка гв. подполковник Е.М. Воробьев. Старшим от ИАС был назначен инженер полка гв. майор Лотарь. Программа войсковых испытаний была очень насыщенной и сложной. Многие вопросы приходилось решать впервые в ВВС (стратосферные бомбометания, ночная подготовка, групповая слетанность и т.д.). В ходе войсковых испытаний десятка МиГ-25РБ, совместно с войсками ПВО, 21-22 июля участвовали в исследовательских учениях по отработке применения средств РЭБ. С 7 по 15 июля проходила отработка тактических и практических бомбометаний со стратосферы на полигоне Полесский, экипажи выполнили 20 практических бомбометаний. С 26 июля по 3 августа, четыре из десяти лидерных МиГ-25РБ, перебазировавшись на предельную дальность в Заполярье по маршруту: Шайковка – Смуравьево – Оленья, приступили к ведению радиотехнической разведки в Баренцевом море, «осваивая Северо-Запад- ный ТВД» (как сказано в официальных годовых отчетах). На самом деле главной задачей являлись полеты из Оленегорска по программе войсковых испытаний, предусматривавшие сброс внешних топливных баков. Программа ВИ была успешно завершена в установленный срок – 1 августа 1973 г. Помимо войсковых испытаний экипажи МиГ-25 неоднократно привлекались к показам новой авиационной техники высшему руководству страны и армии. Только в 1973 г. подобные показы проводились четыре раза на аэродромах Кубинка, Клин, Ахтубинск, Шаталово, при этом наземные показы почти всегда завершались демонстрационными одиночными и групповыми полетами МиГ-25РБ.
После окончания войсковых испытаний была получена директива ГШ ВВС, согласно которой полк переводился с тре- хэкадрильного состава на двухэскадрильный, при этом 2-я эскадрилья полностью вместе с самолетами передавалась в 164-й ОГРАП 4-й воздушной армии Северной группы войск, базировавшийся в Польше на аэродроме Бжег. Взамен, так сказать по обмену, из 164-го полка в Шатолово прибывала эскадрилья на самолетах Як-28Р. Таким образом в начале 1974 г. полк перевооружился на самолеты Як-28Р. Теперь по штату в каждой эскадрильи имелось по 12 боевых и по два учебно-боевых самолета: МиГ-25РБ/РУ в 1-й эскадрилье, Як-28Р/У – во 2-й.
В 1974 г. полк провел два полковых и пять эскадрильских ЛТУ, четыре экипажа МиГ-25РБ выполнили практические бомбометания из стратосферы. Налет за год составил 941 ч на МиГ-25 и 1513 ч на Як-28.
Так как на самолетах МиГ-25 имелся целый комплекс радиотехнического разведоборудования, для работы с ним 20 декабря 1974 г. в полку была официально создана служба РЭР (радиоэлектронной разведки).
С 24 февраля по 3 марта 1975 г. полк полным составом принимал участие в учениях по плану МО СССР «Весна-75». Задания выполнялись на полигоне «Гороховец», а также на полигоне Полесский с выполнением практических бомбометаний из стратосферы. Было выполнено с отличным качеством десять бомбометаний. За отличную боевую выучку, продемонстрированную на этих учениях 18 марта 1975 г. полк награжден Вымпелом МО СССР «За мужество и воинскую доблесть». Вымпел в торжественной обстановке на аэродроме 5 мая 1975 г. вручал личному составу полка ГК ВВС маршал авиации П.С. Кутахов.
7 августа 1975 г. при полете в стратосферу произошла авария самолета МиГ-25РБ, пилотируемого гв. майором С.И. Бухтияровым, причина аварии – обе- сточивание энергосистем самолета.
Неприятности 1975 г. продолжились в следующем году. 31 января 1976 г., при опробовании двигателей после выполнения 200-часовых регламентных работ на самолете Як-28Р, на 7-й минуте начался пожар правого двигателя, пламя охватило всю переднюю часть фюзеляжа с обоими кабинами. Пожар был
