В 1896, 1899, 1900 и 1901 гг. корабль в первую линию не входил и находился либо в излюбленном флотским руководством вооруженном резерве, либо в ремонтах. В этот период экипаж корабля заметно сокращали, и жизнь на нем шла как бы 'в полнакала'.
Но тем не менее, по понятиям столичной верхушки, флот жил. Так в феврале 1901 г. в библиотеку броненосца передали в единственном экземпляре (№ 109) 'секретное издание' 'Сборник сведений о военно-морских флотах иностранных государств'. В качестве дополнения к нему поступил и экземпляр, посвященный только кораблям японского флота. Книги эти доставляли из Главного штаба в штаб флота, а уже оттуда по приказу его начальника контр-адмирала Иениша передавали на крупные боевые корабли.
Спустя четыре месяца, 1 июня, на броненосец пришел очередной документ. В нем говорилось, что 'Ее императорское Высочество княгиня Ксения Александровна изъявила желание, чтобы при проходе Ее Императорского Высочества мимо судов эскадры команды становились для отдания почестей только один раз в день'.
Сейчас можно только догадываться, какие чувства у корабельных офицеров вызвала столь 'важная' бумага – восхищение ли ее добротой и милосердием, или раздражение тем, что к мнению любой особы царской фамилии подобострастно прислушивается высшее руководство флота.
Ясно только то, что постоянные прогулки по морю отдыхавшей на юге Ксении
Александровны были бы менее утомительны для флота только после подобной директивы, ведь приветствие требовало нахождения команд на палубах в течение 20-25 минут на все время прохождения ее великолепной яхты мимо стоявших на рейде кораблей. Столь 'щадящая' директива исходила только от Ксении Александровны. В отношении же других членов царской семьи все оставалось по-прежнему.
В августе 1901 г. флот взбудоражили разговоры о целесообразности телесных наказаний для нижних чинов. Надо отдать должное офицерам – они выступали за их отмену. Вот, что писал по этому поводу в октябре в Главное Военно-морское судебное управление командир 'Двенадцати Апостолов': 'По моему мнению, следует упразднить телесные наказания, как постыдное для человеческого достоинства вообще и особенно для воинского звания. Применение такого наказания к матросу из моей долголетней службы показало, что наказанный таким образом нижний чин считается потерянным для службы, так как он совестится своих товарищей и затем старается совершить проступок, за который его сослали бы в дисциплинарный батальон'.
В новом 1902 г. положение с боевой подготовкой несколько улучшилось. Все более и более взоры руководящей верхушки устремлялись на Дальний Восток, где японский флот неуклонно пополнялся новыми кораблями. Весьма отдаленно, но все же чувствовалось приближение войны с далекой восточной страной. Может быть, поэтому в период с 1902 по 1906 гг. 'Двенадцать Апостолов' ежегодно вводили а кампанию.
С 1 июня по 1 октября 1903 г. броненосец прошел все плавания в составе Практической эскадры под командованием контр-адмирала Кригера. Затем корабль простоял в отряде вооруженного резерва, но уже под командой вице-адмирала Скрыдлова. С 25 февраля по 9 марта 1904 г. 'Двенадцать Апостолов' находился в Алексеевском доке. За это время на нем успели заменить лишь бакаутовые подшипники. 1 мая корабль начал кампанию, но уже, скорее, как учебный корабль. На нем до 1 октября находились ученики одной из учебных команд Севастополя. Затем с 1 октября 1904 г. и до конца года – вновь служба в первой линии боевых кораблей.
С 1 по 8 апреля 1905 г. прошла очередная стоянка в доке – теперь для окраски подводной части.
Цусимская трагедия и поражение в русско-японской войне сразу принизили значение флота для Российской империи. По стране пронеслась Первая революция. Стоя с 21 мая 1905 г. по 1 января 1906 г. в вооруженном резерве, команда броненосца 'Двенадцать Апостолов' активного участия в революции не принимала. После подавления восстания на 'Потемкине', 'Очакове' и в самой Севастопольской крепости на юге медленно стало воцаряться спокойствие. Россия опустилась во времена мрачной самодержавной инквизиции.
Вследствие тревожного положения дел по поводу армянских беспорядков в Турции Практическая эскадра Черного моря под флагом вице-адмирала Дикова не кончила кампанию 15 октября, как предполагалось по программе, но, усилившись броненосцами 'Три Святителя' и 'Двенадцать Апостолов', минным транспортом 'Буг', продолжила плавание, за исключением миноносцев, которые кончили кампанию для ремонта.
21 января вице-адмирал Диков спустил свой флаг и съехал с эскадры, получив другое назначение.
22 января в полночь Главный командир Черноморского флота и портов Черного моря вице-адмирал Николай Васильевич «опытов поднял свой флаг на броненосце 'Синоп' и вступил в командование эскадрой Черного моря с Высочайшего соизволения от 20 января, сообщенным телеграммой Управляющего Морским министерством.
Состав эскадры:
– Эскадренный броненосец 'Синоп' (командир капитан 1 ранга Невражин).
– Эскадренный броненосец 'Екатерина II' (командир капитан 1 ранга Падалка).
– Эскадренный броненосец 'Чесма' (командир капитан 1 ранга Ирецкий).
– Эскадренный броненосец 'Георгий Победоносец' (командир капитан 1 ранга Кузьмич).
– Эскадренный броненосец 'Три Святителя' (командир капитан 1 ранга Мартын).
– Эскадренный броненосец'Двенадцать Апостолов' (командир капитан 1 ранга Лощинский).
– Крейсер I ранга 'Память Меркурия' (командир капитан 1 ранга Бал 1-й).
– Минный транспорт 'Буг' (командир капитан 2 ранга Бал 2-й).
– Минный транспорт 'Дунай' (командир капитан 2 ранга Андреев).
– Минный крейсер 'Гридень' (командир капитан 2 ранга Скаловский).
– Минный крейсер 'Казарский' (командир капитан 2 ранга Овод).
Эскадренный броненосец 'Георгий Победоносец' под флагом контр-адмирала Лаврова, крейсер 'Память Меркурия' под флагом контр-адмирала Остелецкого.
С подъемом флага Главного командира приказано эскадре дополнить запасы провизии и материала для 2-х месячной кампании, а уголь и боевое снабжение до полного.
24 января минные крейсера 'Гридень' и 'Казарский' были спущены с плавучего дока, где они красил подводную часть. Из остальных судов только броненосцы 'Чесма' и 'Три Святителя' имели чистые подводные части, все же остальные не вводилось в док весны 1895 г.
Броненосец 'Три Святителя' стоял на рейде, продолжая работы по заканчиванию проводки электрического освещения и другие работы по корпусу: все же боевое вооружение этого броненосца было закончено и испытано. На всех судах эскадры приспособлены бани для команды, так что по субботам вся команда успевала мыться. Температура в банях была не менее 27°.
С 22 января по 1 февраля эскадра пополнила свои запасы. Суда эскадры перекрашивали все надстройки по верхнюю палубу из белого в желто-шаровой цвет, как менее резкий и заметный.
Старшие штурманские и судовые офицеры изучали телеграфное дело, для чего на броненосце 'Чесма' был прикомандирован чиновник телеграфного ведомства. Под его руководством офицеры обучались умению передавать и принимать с аппарата депеши.
3 февраля миноносцы № 252, 256, 257, 259 и 270 окончили кампанию и вступили в вооруженный резерв.
7 февраля для пополнения полного недостатка офицеров на суда эскадры прибыло из Балтийского флота 24 офицера и 5 механиков. Кроме них, еще с прошлого года на судах эскадры находилось 10 балтийских офицеров.
С 12 февраля начали снаряжать в лаборатории фугасные снаряды для 12-дм орудий.
С 17 по 28 февраля проводил инспекторский осмотр эскадренных броненосцев контр-адмирал Лавров,