В Афганской войне, длившейся для Советской Армии 10 лет (с 1979 по 1989 год), а для разведки, контрразведки и пограничников гораздо дольше — как минимум до 2005 года, принимали участие сотрудники особых отделов КГБ СССР по Туркестанскому и Среднеазиатскому военным, Среднеазиатскому и Восточному пограничным округам, а также сотрудники центрального аппарата военной контрразведки Комитета госбезопасности — 2-го, 3-го и 8-го отделов 3-го Главного управления КГБ СССР.
Ввод советских войск в Афганистан документально оформлен решением ЦК КПСС от 30.12.1979 № 2519-А. Однако распоряжение Министерства обороны СССР в Туркестанский и Среднеазиатский военные округа о подготовке войск к вводу на сопредельную территорию поступило несколько раньше — 12 декабря 1979 года. За две недели в обстановке строгой секретности Туркестанским и Среднеазиатским военными округами отмобилизованы до штатов военного времени более 100 боевых соединений и частей, в том числе две мотострелковых дивизии, артиллерийская, зенитно-ракетная и воздушно- десантная бригады, реактивный артиллерийский полк, отдельный полк связи, отдельный мотострелковый полк, дорожно-строительная, дорожно- комендантская, трубопроводная и автомобильная бригады, бригада материального обеспечения, военно-строительные батальоны и роты, военный и военно-полевой инфекционный госпитали, медицинские санитарные батальоны и роты, медицинские склады. В качестве резерва вводимой группировки развернуто три мотострелковые дивизии. Из запаса призвано более 50 тысяч человек. В ТуркВО создано полевое управление штаба 40-й армии, в САВО — управление 34-го смешанного авиационного корпуса. В проведенных в войсках организационно-мобилизационных мероприятиях исключительно важную роль сыграли принятые особыми отделами меры по контрразведывательному обеспечению скрытого для зарубежных спецслужб развертывания группировки советских войск.
24 декабря 1979 года в войска поступила директива министра обороны СССР Д.Ф. Устинова о вводе ограниченного контингента советских войск в Афганистан. Ввод в ДРА 40-й армии ТуркВО начался в 15.00 по московскому времени, одновременно воздушную границу пересекли военно-транспортные самолеты ВВС с подразделениями воздушно-десантных войск на борту. С передовыми частями в Афганистан вошел Особый отдел КГБ по 40-й армии во главе с полковником С.И. Божковым.
Вместе с тем введенные в декабре войска 40-й армии в Афганистане оказались далеко не первыми, кто обозначил там советское военное присутствие. Еще до масштабного ввода сухопутных сил в Афганистан, 7 декабря 1979 года под Кабул в район авиабазы Баграм были скрытно переброшены отдельный отряд спецназназа ГРУ ГШ («мусульманский батальон»), два батальона и рота десантников. Ими во взаимодействии со спецназом КГБ СССР 27 декабря в Кабуле успешно проведена операция «Шторм-333» по захвату дворца Тадж-Бек — резиденции главы афганского государства Х. Амина.
По мере втягивания советских войск в боевые действия возникла необходимость противодействия применяемой мятежниками тактике партизанской войны подвижными бандгруппами. В этих целях по приказу председателя КГБ Ю.В. Андропова сформирован и направлен в Афганистан разведывательно- диверсионный отряд «Каскад», созданный на основе отмобилизования спецрезервистов Отдельной бригады особого назначения общей численностью около 1000 человек. Должности водителей, стрелков, связистов «Каскада» комплектовались рядовыми, сержантами и прапорщиками пограничных войск.
В боевых действиях постоянно участвовали офицеры военной контрразведки, оперативно обслуживающие части и подразделения 40-й армии. Вся многоплановая оперативно-служебная деятельность военной контрразведки в Афганистане была направлена прежде всего на вскрытие и пресечение агентурного проникновения противника в войска, защиту секретных военных сведений, контрразведывательное обеспечение боевых операций. За 1980–1989 годы особыми отделами вскрыта и пресечена деятельность 44 агентов иностранных спецслужб и 875 агентов бандформирований мятежников. Одной из важнейших задач военной контрразведки в Афганистане был оперативный розыск советских военнослужащих, пропавших без вести или оказавшихся в плену у моджахедов, включавший: сбор информации об их гибели или пленении, обстоятельствах сдачи в плен, местонахождении, сведений о поведении в плену, сотрудничестве с противником и принятие мер по освобождению. Всего за годы Афганской войны сотрудниками военной контрразведки освобождено из плена 98 советских военнослужащих.
Первыми в боевое соприкосновение с афганскими вооруженными отрядами вступили советские пограничники. Сразу же после Саурской революции 1978 года в Афганистане вспыхнула гражданская война, а советско-афганская государственная граница превратилась в зону ожесточенных боестолкновений. В течение 1979 года группы моджахедов вышли к пограничной реке Пяндж на участках Хорогского, Московского и Пянджского пограничных отрядов, где заняли господствующие высоты вдоль границы. На ряде участков границы повсеместно отмечались неоднократные попытки провоцирования пограничных конфликтов, факты минометного обстрела советских населенных пунктов, захвата и уничтожения пограничных нарядов, вооруженного вторжения бандформирований на советскую территорию. В силу объективных причин новое афганское правительство не имело ни сил, ни возможностей противодействовать разгулу бандгруппировок в приграничной с СССР зоне, фактически потеряв контроль за оперативной обстановкой в провинциях на севере Афганистана. В этой связи руководством Советского Союза по предложению Комитета государственной безопасности СССР принято решение охрану и оборону советско-афганской границы осуществлять не только с советской, но и непосредственно с афганской территории, расположив там более шестидесяти подразделений пограничных войск с постоянной дислокацией.
Размещение пограничников на территории сопредельного государства в интересах решения задач обороны и безопасности государства не было для России чем-то новым и необычным. С 1901 по 1920 год существовал Заамурский округ Отдельного корпуса пограничной стражи России общей численностью около 25 тысяч человек. Его функциями были обеспечение безопасности Китайско-Восточной железной дороги и активные действия против хунхузов
