1 отделение (обеспечение очистки освобожденных от немецко-фашистских оккупантов городов и районов и организация агентурной работы в этих районах);
2 отделение (учет и разработка германских разведорганов и осуществление контрразведывательных комбинаций);
3 отделение (выявление, разработка и ликвидация агентуры разведорганов противника в г. Москве);
4 отделение (обеспечение агентурно-оперативной работы по лагерям военнопленных и интернированных и наблюдение за разработками местных органов НКВД);
5 отделение (учет и оперативный розыск агентуры противника, предателей и пособников немецко- фашистских оккупантов);
6 отделение (следственное).
2 отдел:
1 отделение (японская линия);
2 отделение китайская и монгольская линии);
3 отделение (следственное).
3 отдел:
1 отделение (английское);
2 отделение (американское);
3 отделение (Турция, Иран, Афганистан); Следственная группа.
4 отдел:
1 отделение (польское, чешское, югославское, греческое, шведское и норвежское посольства и миссии, военные миссии и колонии, атташат);
2 отделение (организация работы по линии польских нелегальных организаций в генерал- губернаторстве, польская ссылка и лагеря, польские колонии в СССР);
3 отделение (следственное);
4 отделение (представительство свободной Франции и испанская эмиграция);
5 отделение (работа по закордону);
5 отдел (специальные мероприятия):
1 отделение;
2 отделение;
Группа по обслуживанию ИККИ;
Группа 'НН' ('Наружное наблюдение') и установка.
6 отдел (охрана дипломатического корпуса):
1 отделение (обеспечение охраны иностранных представителей — Англии, Америки, Японии и Швеции);
2 отделение (Турции, Болгарии, Ирана, Афганистана, Китая, Югославии, Польши, Чехословакии; полпредств — Монголии и Тувы; эпизодическую охрану иностранных правительственных делегаций и наружное наблюдение за посетителями иностранных посольств);
3 отделение (обеспечение наружного наблюдения за сотрудниками посольств Англии, Америки, Чехословакии, Швеции и Польши);
4 отделение (обеспечение наружного наблюдения за сотрудниками посольств Японии, Турции, Ирана, Китая, Югославии, Монголии, Тувы);
5 отделение (хозяйственно-финансовое, автоколонна); Аппарат офицеров связи при командовании частей польской армии; Аппарат офицеров связи при командовании 1-й чешской бригады.
III. 3 УПРАВЛЕНИЕ НКВД СССР (секретно-политическое) (197 человек по штату):
Руководство; Секретариат управления;
Оперативная группа (регистрация, учет агентуры и антисоветского элемента; учет и обработка материалов 'ПК', наружного наблюдения и других литеров; составление отчетности о движении агентуры и разработок);
Группа по обработке поступающих агентурно-оперативных материалов (обработка и учет поступающих и исходящих агентурно-оперативных материалов и контроль исполнения документов);
(оперативно-денежная отчетность и учет имущества на конспиративных квартирах;
Машбюро.
1 отдел (борьба с остатками антисоветских политических партий и организаций):
1 отделение (разработка остатков правотроцкистского подполья);
2 отделение (разработка исключенных из ВКП(б) по политическим мотивам, семей репрессированного правотроцкистского актива и лиц по особому списку);
3 отделение (разработка остатков бывших антисоветских политических партий и розыск бывших провокаторов).
2 отдел (борьба с антисоветскими формированиями среди академической, научно-технической, гуманитарной, медицинской интеллигенции, работников искусств и литературы, советского управленческого аппарата, аген-турно-оперативная работа среди молодежи):
1 отделение (разработка антисоветских формирований среди писателей, работников издательств и искусств);
2 отделение (разработка антисоветских формирований среди академиков, членов-корреспондентов и научных сотрудников научно-исследовательских институтов;
руководство агентурно-оперативной работой по украинской, белорусской Академии наук и другим филиалам и базам, подведомственным Академии наук СССР);
3 отделение (разработка антисоветских формирований среди медицинской интеллигенции и студенчества;
агентурно-оперативное обслуживание учреждений и предприятий органов здравоохранения; борьба с бактериологической диверсией);
4 отделение (разработка антисоветских формирований среди профессорско-преподавательского состава и студенчества высших учебных заведений, спортивной и учащейся молодежи);
5 отделение (разработка антисоветских формирований среди интеллигенции советского управленческого аппарата, плановых, торговых, кооперативных, юридических и финансовых учреждений и ВЦСПС).
3 отдел (борьба с националистической контрреволюцией):
1 отделение (борьба с грузинской, армянской, азербайджанской и горской националистической контрреволюцией и мусульманским духовенством);
2 отделение (борьба с узбекской, таджикской, туркменской, казахской, киргизской, татаро- монгольской националистической контрреволюцией и мусульманским духовенством);
3 отделение (борьба с украинской, белорусской, молдавской, литовской, латвийской, эстонской и угро-финской националистической контрреволюцией);
4 отделение (борьба с еврейской националистической контрреволюцией).
4 отдел (борьба с церковно-сектантской белогвардейской контрреволюцией; руководство агентурно- оперативной работой и ведение контрольно-наблюдательных разработок по борьбе с повстанчеством в районах РСФСР, а также по кулацкой ссылке):
1 отделение 1 борьба с церковно-сектантской контрреволюцией);
2 отделение (борьба с белогвардейской и белоказаческой контрреволюцией; разработка антисоветских формирований и руководство агентурно-оперативной работой по трудпоселкам и ссылке);
3 отделение (разработка антисоветских формирований среди сельскохозяйственной интеллигенции и студентов сельскохозяйственных вузов; разработка антисоветского элемента и руководство агентурно- оперативной работой в деревне на территории РСФСР).
5 отдел (розыск авторов контрреволюционных листовок, анонимок антисоветского содержания; расследование по заявлениям граждан; информация директивных органов о политических настроениях