Выполнено 80 полетов суммарной продолжительностью 123 ч 55 мин. Переоборудован в вариант М-21 – носитель БПЛА D-21. Демонстрируется в экспозиции Авиационного музея в Сиэттле, шт. Вашингтон.
60-6941 (135)
Выполнено 95 полетов суммарной продолжительностью 152 ч 46 мин. Переоборудован в вариант М-12. Разбился 30 июля 1966 г. над Тихим океаном.
60-6934 (1001)
Первый полет – 7 августа 1963 г., летчик – Джэймс Истхэм. Экипажем в составе полковника Роберта Стефенса и подполковника Дэниэля Андрэ 1 мая 1965 г. была предпринята попытка установления абсолютного мирового рекорда скорости и высоты. Полет не состоялся из-за обнаруженной в ходе предполетной подготовки неисправности двигателя: . Суммарный налет 80,9 ч. Списан 14 августа 1966 г. Элементы конструкции использованы для изготовления самолета SR-71C, серийный номер 64-17981
60-6935 (1002)
Суммарный налет 534,7 ч. Выставлен в музее ВВС на авиабазе Райт-Паттерсон, шт. Огайо.
60-6936 (1003)
Первый полет выполнен экипажем в составе подполковников Роберта Стефенса и Дэниэля Андрэ. 1 мая 1965 г. на этом самолете экипаж в составе полковника Роберта Стефенса и подполковника Дэниэля Андрэ установил абсолютные рекорды высоты и скорости. После полета Стефенса и Андрэ, в тот же день на самолете были установлены мировые рекорды скорости экипажами в составе подполковника Уолтера Дэниэля и майора Джеймса Куни, подполковника Уолтера Дэниэля и майора Ноэля Уорнераю. Суммарный налет самолета составил 439,8 ч. Перехватчик разбился 24 июня 1971 г. в ходе испытательного полета по программе NASA.
64-17950 (2001)
Прототип, 'рабочая лошадка' программы летных испытаний фирмы Локхид. Начало сборки – 10 октября 1963 г., выкатка – 25 августа 1964 г., первый полет – 23 декабря 1964 г., летчик-испытатель Гиллиленд. Списан 10 января 1967 г. в результате инцидента на авиабазе Эдварде, летчик-испытатель фирмы Локхид Арт Петерсон остался жив.
64-17951 (2002)
Обозначался, также, YF-12C. Предназначался для испытаний бортовых систем и оборудования. Начало сборки – 6 декабря 1963 г., выкатка – 20 октября 1964 г., первый полет -5 марта 1965 г. экипаж – летчик- испытатель Гиллиленд и оператор БРЭО Цвейер. Передан ВВС в 1969 г. Передан из ВВС в NASA в качестве замены разбившегося SR-71A серийный номер 60-6937. в сентябре 1971 г. Последний полет выполнен 22 декабря 1978 г., суммарный налет 796,7 ч. Демонстрируется в постоянной экспозиции авиационного музея в Пима Каунти: расположенного в окрестностях авиабазы Таксон, шт. Аризона
64-17952 (2003)
Самолет предназначался для проведения 1-го этапа летных испытаний фирмой Локхид. Начало сборки – 27 января 1964 г., выкатка – 8 декабря 1965 г., первый полет – 24 марта 1965 г. Разбился 25 января 1966 г. в районе Такамкари, шт. Нью-Мескика; летчик Билл Уивер катапультировался удачно, оператор Джим Цвейер погиб.
64-17953 (2004)
Предназначался для проведения летных испытаний фирмой Локхид и ВВС США. Начало сборки – 4 марта 1964 г., выкатка – 19 января 1965 г., первый полет – 4 июня 1965 г., экипаж – Уивер и Андрэ. Разбился 18 декабря 1969 г. в районе Шошона, шт. Калифорния, экипаж в составе подполковника Джо Роджерса и подполковника Гэрри Хейдельбога катапультировался успешно.
64-17954 (2005)
Предназначался для летных испытаний фирмой Локхид и ВВС США. Начало сборки – 8 апреля 1964 г., выкатка – 23 февраля 1965 г., первый полет – 20 июля 1965 г., экипаж – Уивер и Андрэ. Списан 11 апреля 1969 г. после аварии на взлете с авиабазы Эдварде. Экипажу в составе подполковника Билла Скляра и майора Ноэля Уорнера удалось спастись.
64-17955 (2006)
Предназначался для проведения летных испытаний фирмой Локхид,. Начало сборки – 13 мая 1964 г., выкатка – 24 марта 1965 г., первый полет – 17 августа 1965 г, экипаж – Уивер и Андрэ. Последний полет самолет выполнил 24 января 1985 г., суммарный налет 1993,7 ч. Демонстрируется в музее Летно- испытательного центра ВВС США на авиабазе Эдварде. Шт. Калифорния.
Без номера
Экземпляр для статических испытаний. Начало сборки -18 июня 1964 г. окончание сборки – 10 декабря 1964 г.
64-17958 (2009)
Первый серийный самолет. Начало сборки – 1 октября 1964 г.. выкатка – 22 июля 1965 г, первый полет – 15 декабря 1965 г.. экипаж – Уивер и Андрэ. Передан ВВС 10 мая 1966 г. Состоял на вооружении 9-го SRW. На самолете 27-28 июля 1976 г. экипажем в составе капитана Элдона Джорца и майора Джорджа Моргана установлен абсолютный мировой рекорд скорости горизонтального полета на базе 15/25 км. Последний полет выполнен 23 февраля 1990 г., суммарный налет 2288, 9 ч. Демонстрируется на авиабазе Робине, шт. Джорджия.
64-17959 (2010)
Предназначался для проведения летных испытаний фирмой Локхид. Начало сборки – 3 ноября 1964 г., выкатка – 19 августа 1965 г., первый полет – 20 декабря 1974 г., экипаж – Уивер и Андрэ. Состоял на вооружении 9-го SRW. Последний полет выполнен 29 октября 1976 г., суммарный налет 866,1 ч. Единственный самолет, на котором было установлено хвостовое оперение большей площади. Первый полет с новым оперение выполнен 3 декабря 1975 г. Демонстрируется в постоянной экспозиции музея Авиационного вооружения ВВС США на авиабазе Эглин, шт. Флорида.
64-17960 (2011)
Серийный самолет. Начало сборки – 8 декабря 1964 г., выкатка – 20 сентября 1965 г., первый полет – 9 февраля 1966 г. экипаж – Уивер и Андрэ. Состоял на вооружении 9-го SRW. Последний полет выполнен 27 февраля 1990 г.. суммарный налет – 2669, 6 ч. Выставлен на авиабазе Кэстл, шт. Калифорния.
64-17961 (2012)
Серийный самолет. Начало сборки – 13 января 1965 г., выкатка – 19 октября 1965 г, первый полет – 13 апреля 1966 по, экипаж – Уивер и Андрэ. Состоял на вооружении 9-го SRW. Последний полет выполнен 2 февраля 1977 г., суммарный налет 1601 ч. Передан на хранение в Чикагский музей науки и промышленности на авиабазе Бил, шт. Калифорния.