1988 г. на опытном самолете «Грипен» 39-4 прошла испытания система заправки топливом в полете, разработанная английской фирмой «Флайт Рефьюлинг». В качестве самолета-заправщика использовался принадлежащий ВВС Великобритании самолет Виккерс VC. 10 К.Мк.З. В 2003 г. некоторые военно- транспортные самолеты шведских ВВС Тр84 «Геркулес» были оборудованы подкрыльными системами заправки топливом в полете. В качестве самолета-заправщика используются также самолеты Боинг KC- 135R. Исследовалась возможность использования на самолете «Грипен» двигателя SNECMA М88 или варианта ТРДДФ Евроджет EJ200 с системой управления вектором тяги, но из-за финансовых проблем идею отклонили.
Весной 2006 г. ВВС Швеции объявили о намерении сократить парк истребителей «Грипен» до 100 единиц. Это будут только самолеты в вариантах JAS 39C/D. По мнению авиационных специалистов, такое количество истребителей, доведенных до уровня поколения «4++», вполне хватит для решения боевых задач. В июне 2007 г. во время Парижской авиационно-космической выставки представители фирмы SAAB сообщили, что в апреле правительству Швеции передано предложение о переоборудовании 31 самолета JAS 39А/В в модификацию JAS 39C/D. В результате на вооружении ВВС окажется 100 истребителей в варианте JAS 39C/D. Оставшиеся самолеты JAS 39А/В будут законсервированы и по мере появления новых покупателей станут дорабатываться также в вариант JAS 39C/D.
В августе 2007 г. министр обороны Швеции Стен Толгфорс одобрил планы по модернизации 31 самолета JAS 39А/В. На вооружении ВВС находилось 70 самолетов JAS 39А и 14 самолетов JAS 39В; около 40 самолетов находились на консервации. Контракт стоимостью 600 млн. долл. на переоборудование самолетов был подписан между фирмой SAAB и FMV в середине октября 2007 г.
В 1995 г. во время Парижской авиационно-космической выставки между фирмами SAAB и «Бритиш Аэроспейс» (в настоящее время «БАЕ Системз») было подписано соглашение о партнерстве в области маркетинга, производства и послепродажного обслуживания истребителей «Грипен» на международном рынке. Было образовано совместное предприятие (СП) «Грипен Интернешнл». Шведская сторона полагала, что англичане помогут выйти на внешний рынок, так как обладают разветвленной маркетинговой сетью. Истребитель практически полностью строится в Линчёпинге, фирма «БАЕ Системз» занималась производством основных опор шасси. Одно время шла речь о сборке некоторых частей фюзеляжа для экспортных истребителей на заводе фирмы «БАЕ Си- стемз» в Бро (Великобритания). Однако большого успеха шведско-английское партнерство не принесло, и с 1 января 2005 г. СП «Грипен Интернешнл» прекратило свое существование в начальном виде. Фирма «БАЕ Системз» вышла из его состава, все права на экспортную деятельность перешли к фирме SAAB, которая сохранила структуру «Грипен Интернешнл» в качестве дочернего предприятия.
Экспортный вариант истребителя «Грипен» имел условное обозначение JAS 39Х. По сути дела он представлял собой самолет, соответствующий вариантам JAS 39C/D из третьей серийной партии. На нем сохранились все основные системы исходных вариантов: цифровая ЭДСУ, систему обмена данными, силовая установка и т. д. Кроме этого на нем решили применить подкрыльные пилоны для подвески вооружения, соответствующие стандартам НАТО, подвесной контейнер с лазерным целеуказателем и системой FLIR и нашлемный прицел с очками ночного видения. В марте 1998 г. для установки на экспортные истребители была выбрана интегрированная система РЭП Эриксссон EWS 39. Все надписи в кабине экипажа выполнены на английском языке. Тем не менее, конкретная комплектация экспортного варианта самолета «Грипен» определяется заказчиком. Если до 2006 г. фирма SAAB в год выпускала по 18 истребителей, то с наличием экспортных заказов темп производства может со временем возрасти до 28. В свое время СП «Грипен Интернешнл» полагало, что на внешний рынок может быть поставлено почти 400 самолетов «Грипен».
Специалисты СП «Грипен Интернешнл» были уверены, что наиболее потенциальными покупателями самолета являются страны Южной Америки и бывшей Восточной Европы. Поэтому первый контракт ожидался именно из этих регионов. Вместо этого в ноябре 1998 г. контракт на поставку 28 истребителей «Грипен» был подписан с ВВС ЮАР, согласно которому в 2007 – 2009 гг. будут поставлены 9 двухместных самолетов JAS 39D, а в 2009 – 2012 гг. – 19 одноместных самолетов JAS 39С. Чуть позднее заказ сократили до 26 машин. К сборке первого экспортного истребителя JAS 39D фирма SAAB приступила в середине января 2005 г. Истребители «Грипен» придут на смену устаревшим самолетам Атлас «Чита» С и D, представляющим собой лицензионный вариант французского истребителя Дассо Авиасьон «Мираж» IIIEZ. Они станут оснащаться некоторыми бортовыми системами и вооружением, разработанными фирмами ЮАР, в частности, планируется использовать нашлемный прицел-целеуказатель производства фирмы «Денел», который будет совместим с УР класса воздух – воздух «А-Дартер», также созданной в ЮАР. Для обучения процессу заправки топливом в полете в марте 2005 г. в Линчёпинг прибыл из ЮАР самолет-заправщик Боинг 707- 328С.
Первый самолет (JAS 39D) для ВВС ЮАР был построен в октябре 2005 г. Его летные испытания начались 11 ноября 2005 г. на заводе в Линчёпинге. В состав экипажа входили летчик-испытатель фирмы SAAB и летчик-испытатель ВВС ЮАР. После завершения 25-часовых летных испытаний самолет был отправлен морским путем в ЮАР. Из порта Кейптауна он был на трейлере в разобранном виде доставлен на авиабазу Истерплаат, откуда он перелетел на авиабазу Оверберг, где находится летно-испытательный центр ВВС ЮАР. 30 апреля 2008 г. состоялось официальное принятие истребителя «Грипен» на вооружение.
13 августа 2008 г. в Кейптаун на борту грузового судна были доставлены два двухместных самолета JAS39D (№ 3 и No 4). Из порта истребители на тягачах перевезли на авиабазу Истерплаат, где их собрали. После проверки оба самолета перелетели на авиабазу Макхадо, где их включили в состав 2-й эскадрильи. В начале марта 2008 г. туда прилетел самолет № 2, а первый истребитель в течение двух лет будет находиться на авиабазе Оверберг и продолжать летные испытания.
Подписание контракта с ЮАР заставило проявить интерес к истребителю «Грипен» и в других странах. В ноябре 2001 г. вторым покупателем стала Венгрия, незадолго до этого вошедшая в состав НАТО. Было подписан протокол о 10-летнем лизинге 14 истребителей «Грипен» HU (12 одноместных и 2 двухместных) с возможностью покупки в будущем дополнительных самолетов. В начале февраля 2003 г. было подписано межправительственное соглашение о лизинге истребителей на период до 2016 гг., после чего они станут собственностью Венгрии. Все самолеты полностью отвечают стандартам НАТО.
Местом базирования истребителей выбрана авиабаза в Кечкемете, где дислоцируется 59-е тактическое авиакрыло. Предназначенные для Венгрии самолеты относятся к самолетам первой серийной партии, которые в результате реструктуризации ВВС Швеции оказались на консервации. Переоборудование самолетов из исходных вариантов JAS 39А/В в варианты JAS 39C/D взяло на себя существовавшее в то время СП «Грипен Интернешнл». Во время доработки на них установили систему заправки топливом в полете и радиосвязное оборудование, соответствующее стандартам НАТО, а также усилили конструкцию крыла для обеспечения подвески КАБ «Пейвэуй» с лазерным наведением.
Первый венгерский одноместный самолет JAS 39С «Грипен» HU (номер 39301) приступил к летным испытаниям на заводе в Линчёпинге 16 февраля 2005 г., одновременно венгерские летчики начали процесс обучения. 21 марта 2006 г. на авиабазу в Кечкемете прибыли первые пять самолетов: три в варианте JAS 39С и два – JAS 39D. 30 марта того же года Министерство обороны Венгрии официально приняло на вооружение истребитель «Грипен» HU. Программа поставок всех самолетов завершилась в середине декабря 2007 г.
В декабре 2001 г. Чехия (также ставшая членом НАТО) объявила о намерении принять на вооружение