Ракеты с ИК-наведением, в силу специфики их использования, могут размещаться исключительно на внешней подвеске. Для преодоления данного ограничения в настоящее время ведется работа над пилонами для F-35 с низкой ЭПР. Кроме того, самолет не предназначен для ведения боя на больших высотах и на виражах. Он также имеет серьезные скоростные ограничения при пуске ракет.
Американские летчики-истребители считают, что в ракетном воздушном бою характеристики ракеты доминируют над ЛТХ самолета.
Критика программы F-35
Штаб-квартира программы выделила несколько групп вопросов, связанных с программой F-35, вызывающих наибольшую критику со стороны независимых экспертов, и дала на эту критику официальные ответы…
Технические риски
Критикуется высокая общая степень технического риска программы. В то время как выпуск двух других серийных американских истребителей F-22A и F/A-l 8E/F вскоре завершится, F-35 еще не закончил летные испытания. График программы неоднократно срывался, отставание составляет более 30 месяцев, имеется огромный перерасход средств, а масса пустого самолета в зависимости от варианта, превышает расчетную (2002 г.) на 1050…2180 кг.
Стоимостной аспект
Независимые аналитики рассчитали, что отпускная стоимость самолетов, особенно на ранних этапах производства, окажется значительно выше, чем декларировавшиеся ранее 60 млн. долл. На первом этапе полномасштабного производства можно говорить о цене порядка 100 млн. долл.
Боевые возможности
Принадлежность F-35 к пятому поколению истребителей не обеспечивает ему доминирования над усовершенствованными машинами четвертого поколения. Самолет несет недостаточно ракет воздушного боя, имеет относительно невысокую скорость и неважную маневренность. Состав и ассортимент вооружения, размещаемого на внутренней подвеске, что обеспечивает самолету скрытность применения, весьма невелик. При использовании внешних подвесок теряется преимущество малой радиолокационной заметности. Самолет лишен многих активных элементов самообороны – в частности, не предусмотрена возможность использования буксируемой ложной цели.
Радиолокационная заметность
ЭПР F-35 обусловлена двумя факторами: внешней формой самолета и применяемыми радиопоглощающими материалами (РПМ). В любом случае, эта величина неизменна. В то же время средства обнаружения малозаметных ЛА, такие, как СВЧ- радиолокаторы, прогрессируют.

Зависимость импортеров от поставщика
Политика строгого засекречивания мер по поддержанию малой радиолокационной заметности (величины ЭПР, характеристики РПМ), использующихся при разработке полетных заданий, с одной стороны, и жесткая система логистики и снабжения запчастями, разработанная для F-35, жестко привязывают иностранных эксплуатантов самолета к его поставщикам. Кроме того, шина скрытного обмена информацией фирмы «Харрис» не будет давать возможности самолету в режиме скрытности передавать информацию получателям, оборудованным шинами других типов.
Возможное урезание прочих оборонных программ в пользу программы F-35
Существует опасение, что как в ближайшем, так и в более отдаленном будущем, финансирование критичных для обороноспособности США разработок и НИОКР в области авиации, таких, как истребитель F- 22, бомбардировщик нового поколения, палубный боевой БПЛА, будет урезаться в пользу программы F-35. При этом F-35 не сможет эффективно действовать как в противопартизанских конфликтах типа Афганского, так и в операциях против «серьезных» стран со значительной территорией, где потребуется дальность действия более 1 100 км.
Эффективность и стоимость СКВВП
Стоимость СКВВП F-35B и его эксплуатационные расходы значительно выше, чем у двух других моделей, в то время как полезная нагрузка и дальность действия у него значительно ниже. В то время как «Харриер» может действовать с коротких, слабо подготовленных грунтовых полос и с вертолетных площадок кораблей, аналогичные возможности более тяжелого F-35B, обладающего более значительной тягой и высокой температурой реактивной струи, вызывают сомнения.
Возможности F-35 по ведению РЭБ
Иностранные эксплуатанты не будут иметь права как-либо перенастраивать и модифицировать функцию ведения РЭБ на самолете F-35, заявил директор программы Ч. Дэвис. Данный вопрос возник после того, как израильские фирмы «Элбит» и «Элта» выразили недовольство в связи с тем, что их отстранили от разработки программного обеспечения и архитектуры системы РЭБ для F-35. Поскольку ВВС Израиля имеют весьма отличные от американских представления и требования к радиоэлектронной войне, «Элбит» и «Элта» ранее внесли значительные изменения в пакеты программного обеспечения (ПО) и в аппаратуру РЭБ на самолетах F-15I и F-16I. Израиль готов приобрести 25 самолетов F-35A с опционом на приобретение еще 50 машин. Первоначально израильская сторона рассматривала вариант покупки СКВВП F-35B, но после анализа по критерию «стоимость – эффективность», выбор был сделан в пользу самолета с обычным взлетом и посадкой. Штаб-квартира настаивает на том, чтобы пакет ПО был модернизирован на фирме-изготовителе самолета в соответствии с конкретными требованиями израильской стороны. Какую-либо модернизацию ПО и/или бортового оборудования израильтянами без согласования с изготовителем американская сторона