Португальцы тщательно осмотрели город. Перед дворцом шаха располагалась огромная площадь. Его окружали благоухающие сады и изящные деревянные павильоны. По великолепию он не уступал дворцу в Каликуте. В конюшнях нашли сто пятьдесят арабских лошадей. Вдобавок в распоряжении шаха была сотня слонов.
Выяснилось, что рассказ Тимоджи о военных приготовлениях румов оказался правдив. На верфях действительно строились карраки. В арсенале у румов были пушки, порох и мечи. Кроме того, португальцы отыскали кузницы и инструменты, при помощи которых изготавливалось оружие и снаряжение для предстоящей морской экспедиции. Губернатор приказал закончить строительство кораблей, которые должны были вступить в ряды португальского флота.
Албукерк с большим пылом взялся за создание португальского Гоа. Это было первое территориальное приобретение в Азии. Чтобы продемонстрировать, что португальцы здесь надолго, в течение двух недель Албукерк приказал «отчеканить новые деньги во славу его величества в этом новом владении короны». Обстоятельства, при которых было принято это решение, отражали, насколько хорошо Албукерк понимал сложившуюся ситуацию. Видные жители города обратились к нему за помощью, сообщая, что на Гоа отсутствует своя валюта, необходимая для того, чтобы улучшить торговлю. Новой монетой должен был стать крузадо — оно же мануэл, сверкающий золотой диск с крестом на одной стороне и армиллярной сферой на другой. Этот астрономический прибор был символом португальского короля. Каждая монета весила 4,56 грамма и была тяжелее своего португальского эквивалента. Чтобы официально объявить о введении новой валюты, монеты пронесли по улицам в серебряных чашах под звуки барабанов и труб. Шествие сопровождали клоуны, танцоры и герольды, объявлявшие и на португальском языке, и на местном наречии о том, что «это новые деньги нашего правителя короля, который приказывает, чтобы они имели хождение в Гоа и его окрестностях».
Подобное внимание к деталям характеризует личность Албукерка во всей ее сложности. Практичный и гибкий администратор, быстро ухватывающий специфику местных условий, он способен был действовать по ситуации и в случае необходимости корректировать планы. Но в то же время Албукерк страдал от непомерного эгоцентризма, из-за которого у него возникало немало проблем. На монетах меньшего достоинства кроме сферы была изображена также буква «А», «чтобы показать, кто их отчеканил». Подобные действия давали в руки врагов Албукерка оружие против него. Кроме того, из-за них в Португалии распространились слухи, что губернатор планирует превратить Гоа в свою собственную вотчину.
Первые шаги в сфере колониального управления сопровождались ошибками. Изначально собирать налоги пору чили Тимоджи, однако его действия вызвали недовольство обоих сообществ, и индуистского, и мусульманского. В результате политику пришлось менять. Хотя Албукерк обещал жителям свободу вероисповедания, индуистский обряд сати — сжигание вдовы на погребальном костре умершего мужа — привел его в ужас. Албукерк запретил эту практику. Приверженность христианской миссии и простое упрямство заставляли Албукерка принимать решения, вызывавшие неудовольствие местных жителей.
Вскоре прибыли два посла, один от шаха Измаила, шиитского правителя Персии, другой от давнего противника Албукерка, Хуага-аты из Ормуза. Оба собирались просить Адиль-шаха поддержать их в борьбе против португальцев. И тот и другой пришли в замешательство, обнаружив, что Адиль-шах бежал, а место правителя теперь занимает Албукерк. Тем не менее Албукерк рассудил, что наладить отношения с Измаилом будет весьма выгодно, поскольку он является заклятым врагом суннитов-мамлюков. Албукерк предложил совместную операцию. Португальцы нападут со Средиземного и Красного морей, а шах — с востока. «Затем, если Богу будет угодно, чтобы этот союз оказался долговечным, можно обрушить всю силу на город Каир и земли султана, а мой правитель король захватит Иерусалим и все земли с этой стороны». Таким образом, представлялся шанс исполнить мечту Мануэла о крестовом походе. Албукерк отправил своего посла к шаху с этим предложением, а также передал ему примирительное письмо, которое по пути должно было быть доставлено марионеточному правителю Ормуза. В нем Албукерк предлагал забыть былые разногласия. На роль посла был выбран Руй Гомеш, однако, к несчастью, до Персии он так и не добрался. Хуага-ата отравил его в Ормузе.
Губернатор понимал, что действовать нужно быстро. Пока оборонительные силы находились в неудовлетворительном состоянии. Было ясно, что рано или поздно молодой Адиль-шах объявится снова и попытается вернуть важный торговый порт. Ремонт стен тормозило слишком малое количество известки, из которой делали раствор. Приходилось возводить стены из камня и глины. Понимая, что время поджимает, Албукерк приказал вести работы сутками по сменам, чтобы как можно быстрее построить оборонительные укрепления на случай возможной атаки. Губернатор днем и ночью следил за ходом работ. Он был намерен удержать Гоа любой ценой. Но к апрелю португальцами овладело беспокойство. Многие португальцы не разделяли видения своего губернатора. Приближался сезон дождей. Кроме того, до Гоа доходили слухи, что Адиль-шах собирает большую армию. Из-за суровости Албукерка отношения с местными жителями несколько испортились, и некоторые капитаны хотели бы вернуться в Кочин. Если не отплыть в ближайшее время, придется надолго задержаться на острове из-за дождей, не говоря уже о том, что, возможно, к тому времени город окажется под осадой. Португальцы успели заметить, что излюбленная тактика их врагов — дождаться сезона дождей и морских штормов и нападать, когда поддержки извне не предвидится. Однако Албукерка трудно было сбить с толку. Гоа — португальский город, таковым и останется.
Между тем в апреле Адиль-шах поднял в своем королевстве восстание. Албукерк не знал, что ради своей цели Адиль-шах даже заключил мир с Виджаянагаром, на время забыв о былой вражде. Ловушка для португальцев была уже приготовлена. В том же месяце Адиль-шах поручил своему военачальнику Палуд-хану отправиться на Гоа с большой армией, численность которой, предположительно, составляла около 40 тысяч человек, и отобрать власть у захватчиков. В ряды этой армии входили хорошо обученные бойцы из Ирана и Центральной Азии. Когда военные силы добрались до берегов реки