Переход в руки англичан испанских плацдармов в Дюнкерке и на далекой Ямайке заставил короля Филиппа IV пойти на заключение мира.
Переговоры, спланированные королевой Анной Австрийской и кардиналом Мазарини, привели к рассмотрению возможности брачного союза между молодым королем Людовиком XIV и дочерью Филиппа IV Марией Терезой. Папа Александр VII и его советник кардинал Сфорца Паллавичино благословляли этот союз. Паллавичино, прекратившийся теперь в одного из самых близких советников папы и даже вырвавший у кардинала Коррадо командование Священным Альянсом, видел в этом династическом браке возможность умерить воинственность Франции по отношению к ослабевшим папским областям.
Брак, заключенный в 1658 году, открыл дорогу к под писанию 7 ноября 1659 года на испано- французской границе Пиренейского мира. В документе, в который и папа Александр VII внес свою лепту, Франция делала много уступок.
Конде, глава Фронды, получал обратно все свои владения. Французские войска выводились из Каталонии, а также из многих других областей, снова переходивших под власть Испании. Португалия, хотя она и смогла сохранить независимость, была принесена в жертву Франции. Владения Испании в Италии и Франш-Конде в Бургундии остались нетронутыми. Хотя было совершенно очевидно, что Пиренейский мир, как и мир Вестфальский, был заключен по причине полного изнеможения сторон, Франция являла себя на фоне все более слабнувшей мощи Испании как новая европейская сила.
9 марта 1661 года умер кардинал Мазарини. С его смертью началась эпоха абсолютной монархической власти Людовика XIV и вместе с ней абсолютного господства Франции во всей Европе.
Все это время папа Александр VII оставался лишь пассивным наблюдателем событий, которые происходили в растревоженной Европе. Меньше всего на свете римский понтифик желал смены настроения своей могучей соседки — Франции, но некая таинственная рука готова была сделать так, чтобы эти настроения изменились в самую опасную сторону.
Два очень серьезных инцидента едва не спровоцировали открытую войну между Людовиком XIV и папой Александром VII. Первый инцидент произошел 11 июня 1662 года, когда новый посланник Франции в Риме, герцог де Креки, попытался прийти на прием к понтифику в сопровождении двух сотен вооруженных гвардейцев.
Креки считал, что папа должен был воздать ему почести представителю Людовика XIV, но папа придерживался но этому поводу иного мнения. Кардинал Паллавичино приказал корсиканской гвардии выстроиться у входа в резиденцию папы и ни в коем случае не допустить проникновения вооруженных людей в покои понтифика. Тогда посланник де Креки подал протест государственному секретарю кардиналу Роспильози и сообщил о нанесенной ему как посланцу французской короны обиде Людовику XIV.
Второй инцидент имел место 20 августа 1662 года, когда четыре человека, по-видимому, агенты Священного Альянса, повздорили с тремя французскими дипломатами. То, что началось как обычная ссора, закончилось уличной дуэлью на шпагах невдалеке от дворца Фарнезе, где располагалась французская дипломатическая миссия. Звон шпаг в конце концов привлек внимание наряда папской корсиканской гвардии, который патрулировал окрестности, и наряда французских солдат, которые стояли на страже у здания французской миссии. Прибыв на место схватки, патрули обнаружили смертельно раненных двух французов и одного агента Священного Альянса. Остальных участников дуэли арестовали и отправили в карцер казарм корсиканской гвардии, преодолев сначала серьезное сопротивление со стороны французских солдат.
Три агента Священного Альянса оказались старыми членами «Черного Ордена», которым командовала Олимпии Майдалькини, и были отпущены на свободу. Похоже, кардинал Паллавичино решил реанимировать «Черный Орден» в виде контрразведывательной службы, несмотря на противодействие папы Александра VII. Сфорца Палламичино хотел сохранить в качестве мощного кулака подобранных Майдалькини людей, а также секреты, накопленные за годы пребывания во главе понтификальной разведывательной службы свояченицы папы Иннокентия X.
Когда в Париже стало известно о втором инциденте, Людовик XIV приказал немедленно выдворить из Франции папского нунция, французские войска пришли и движение и заняли графство Авиньон, и, наконец, вся армия получила приказ готовиться к продолжительной карательной кампании против горделивого папского государства. Война стучалась в двери Ватикана, и на сей раз слабая Испания мало что могла сделать для ее предотвращения.
Александр VII сделал попытку искать посредничества герцогини-регентши Савойи, тетки Людовика XIV, но безрезультатно. Папа вынужден был стерпеть унижение и принять условия Пизанского договора, который был подписан 12 февраля 1664 года. Кардинал Киджи и кардинал Империали, правитель Рима, были отправлены в Париж для принесения извинений Людовику XIV. Марио и Агостино Киджи, родственники папы, были посланы во дворец Фарнезе для принесения извинений французскому послу, герцогу де Креки. Корсиканские гвардейцы были уволены, а сама часть распущена. Кардинал Паллавичини был отстранен от государственной деятельности и отодвинут на второй план, хотя в пределах стен Рима он сохранил прежнее могущество.
Тем временем папа Александр VII обеспечил себе заметное место в истории, подписав 18 февраля 1664 года «секретную буллу», в которой протестовал против «принуждений со стороны французов» и принятия условий Пизанского договора, который он подписал только несколькими днями раньше для спасения Италии от иноземной оккупации:
«Мы заявляем, следовательно, что пред лицом таких деяний мы подчинились насилию, силе и необходимости, ибо никоим образом не могли оказать сопротивления согласно нашему желанию и воле. Приказы-паю, чтобы настоящий протест и декларация, написанная нами, расценивались как утверждающие истину полностью и в полную силу, хотя бы мы и не смогли обнародовать сей документ».
(Совершенно ясным является то, что грубость, проявленная Людовиком XIV в отношении папы после инцидента 20 августа, была только предлогом, чтобы унизить Рим, Александра VII, его правительство и католическую церковь. И, даже лежа на смертном одре, понтифик спрашивал с герцога де Шоля за оскорбление, нанесенное нунцию в Париже, и ущерб, причиненный королевской властью французской церкви. Папа Александр VII скончался 22 мая 1667 года в возрасте семидесяти девяти лет н был похоронен в великолепном мавзолее, который Бернини возвел для него в базилике Святого Петра.
Смерть Александра VII вызвала новую волну активности Священного Альянса в Азии.
Европейские дипломатические миссии стали появиться в Китае начиная, вероятно, с 1668 года — года свержения династии Минь, и пользовались благосклонностью правительства Кинь. В 1668 году там, видимо, появились голландцы, а в 1670 году их примеру последовали португальцы. За португальцами последовали русское посольство и, уже в начале XVIII века, посольство государства Ватикан, что превратило Китай в еще одну арену раздиравших Европу политических и религиозных распрей и, следовательно, в идеальное поле для операций агентов той и другой сторон.
Первым появившимся в Китае агентом Рима был, по-видимому, голландец по имени Олферт Даппер, который прибыл в Азию в 1667 году по приказанию ван Хорна. Даннер пытался достичь с высшими иерархами двора Кинь договоренности о предоставлении эксклюзивной торговой концессии его стране в ущерб интересам других стран Европы. Договоренность включала прекращение взимания налогов с голландских судов, швартовавшихся в портах Китая.
Когда папа Климент IX узнал о происках Голландией, он приказал своим агентам устранять любые препятствия, которые могли бы встать на пути кораблей и интересов католических государств в Китае. 11 октября 1668 года Олферт Даппер был найден обезглавленным в одной из трущоб Кантона недалеко от порта.
Жившие в городе европейцы решили, что это было делом рук какой-нибудь китайской банды, хотя в пределах европейских миссий ходили также разговоры о том, что голландский дипломат и коммерсант был казнен «Кругом Октагон», тем самым, к которому принадлежал Жан-Франсуа Равальяк, убийца французского короля Генриха IV, или «Черным Орденом». Как бы то ни было, не подлежит сомнению, что убийство Олферта Даппера на много лет задержало подписание договора между Голландией и Китаем.
Ввиду скоропостижной смерти Климента IX 9 декабря 1669 года конклав вынужден был собраться вновь. Не менее шести партий вели спор о том, кто должен прийти на смену столь недолго властвовавшему