К концу августа 1943 г Ju 88 составляли лишь незначительную часть ночных истребителей - имелась только одна группа полностью переоснащенная на этот тип - IV/NJG 3 на Каструпе и Люнебурге. Правда, Ju 88С и Ju 88R имели некоторые эскадрильи IV/NJG 1, I/NJG 2 и I и II/NJG 3, а отдельные группы NJG 100 и 200 использовали Ju 88 вместе с Do 217J-2 и Bf 110 на Восточном фронте. I/NJG 100 действовала на центральном и южном секторах фронта в составе 4-го и 6-го воздушных флотов, a I/NJG 200 действовала на северном секторе в составе 1-го воздушного флота.
Производство истребителей Ju 88 в течение 1943 г составило 706 самолетов, и к концу года в центральном воздушном командовании уже имелись с этим типом три группы NJG 2 с 64 Ju 88C-6b, I, II и IV группы в NJG 3, и по одной группе в NJG 1 и 6.
Хотя планер Ju 88-6с практически не отличался от своего предшественника, новый истребитель получил ряд доработок, значительно повысивших гибкость его применения по сравнению с периодом до появления диполей. Ju 88С-6с были оснащены локаторами FuG 220 'Лихтенштейн' SN-2, хотя некоторые машины имели и 'Лихтенштейн' С-1, отличаясь лесом антенн в носу. Причиной этого была слишком большая минимальная дальность обнаружения SN-2 - 400 м. У С-1 эта величина была 200 м. Доработка SN-2 позволила позже отказаться от такой двойной установки. Некоторые Ju 88С-6с получили устройство предупреждения об облучении локатором H2S английских ночных истребителей - FuG 350 'Наксос''-Z и устройство пеленгации локатора предупреждения 'Моники' на хвосте британских бом-бардировщков -FuG 227 'Фленс-бург'.
Первоначально Ju 88С-6с сохраняли двигатели Jumo 2I1J-1 и J-2, но потом некоторые машины получили Jumo 21 1 Н с турбокомпрессором DFL (Немецкого авиационного иститута) - ТК 11а. С ними максимальная скорость на высоте 9200 м достигала 535 км/ч. Но их установка вела к значительному росту веса самолета, что осложнялось использованием на истребителе нового оборудования, дополнительного бронирования и вооружения. В результате таких самолетов было не много. Наступательное вооружение осталось без изменений -три пушки MG FF/M и три пулемета MG 17. Оборонительное вооружение состояло из 13-мм пулемета MG 131 на подвижной установке в конце кабины. На Ju 88С-6с стала использоваться и дополнительная пушечная батарея в установке 'шраге музик'(джаз) - две 20-мм MG 151 с 200 снарядами на ствол.
'Шраге музик' устанавливалась в центральной секции фюзеляжа. Две пушки вели огонь под углом 70° к горизонту без использования трассирующих боеприпасов, чтобы достигнуть эффекта внезапности. До установления контакта с использованием SN-2 пилот и бортинженер вели наблюдение вперед и в стороны, а радист наблюдал за экраном локатора и назад. Если после радиолокационного контакта пилот выбирал способ атаки с помощью 'шраге музик', то радиооператор старался направить его на максимальное сближение с целью ниже высоты ее полета на 300 м, чтобы избежать обнаружения хвостовым локатором бомбардировщика - 'Моники'.
Ведя наблюдение по экрану локатора, радиооператор направлял пилота, пока последний не сообщал о визуальном контакте. Локатор выключался. После занятия истребителем позиции для стрельбы скорость уменьшалась. Пилот наводил 'шраге музик' при помощи прицела 'Реви' C/I2D, укрепленного на верхнем переплете фонаря кабины. Требовалось, чтобы дистанция между истребителем и целью была не больше 300 м, но некоторые опытные пилоты подходили к бомбардировщикам так близко, что привозили на базу 'останки' своих жертв.
Тактика 'Дикого кабана', используемая после потери эффективности системы 'Химмельбетт', оказалась не очень подходящей для плохих погодных условий конца 1943 г, но с появлением в начале 1943 г локатора 'Лихтенштейн' SN-2 вновь стал возможен перехват английских бомбардировщиков на подходе к цели,и при возвращении на базу. Была отработана тактика 'Прирученного кабана' - непрерывного воздействия истребителей ПВО по бомбардировщикам. С новым оборудованием и тактикой немецкие 'ночники' стали наносить британскому бомбардировочному командованию такие потери, которые последние никогда до того не испытывали. 21 января 1944 г во время налета на Магдебург англичане потеряли 55 самолетов из 648 или 8,5%. Через неделю во время налета на Берлин были сбиты 43 машины из 683 -6,3%. 19 февраля во время налета на Лейпциг из 823 самолетов были сбиты 78 машин -9,4%. 24 марта из 810 бомбардировщиков, бомбивших Берлин, было сбито 72 - 8,9%. И, наконец, 30 марта из 795 'Галифаксов' и 'Ланкастеров', бомбивших Нюрнберг, было сбито 94.
Для британского бомбардировочного командования уровень потерь 11,8% был неприемлем. Бомбардировщики испытывали на маршруте постоянный прессинг ночных истребителей, многие из них сбивались или, получив повреждения, сбрасывали бомбы не доходя до цели, а большинство оставшихся доходило до цели разрозненными, группами. Стратегическое наступление на 'третий рейх' стало делом очень дорогостоящим, и британское бомбардировочное командование переключилось на налеты по коммуникациям во Франции и Бельгии. Ночные истребители одержали самую значительную свою победу, оказавшуюся последней.-
J и 88G-1
Опытный Ju 88G VI
К моменту приостановления налетов на Германию Ju 88С-6с уже составляли костяк ночных истребителей, если чуть ли не весь их состав, а сборочные линии Ju 88 практически полностью переключились на выпуск истребительного варианта. Постоянное расширение состава оборудования отрицательно сказалось на летных данных истребителя, но, что еще более важно, на его управляемость на малых скоростях - увеличилась скорость сваливания, посадочная и взлетные скорости также возросли, продольная устойчивость ухудшилась. В результате резко возросли эксплуатационные потери. В 1943 г Ju 88R-2 с двигателями BMW 80ID получили новое, увеличенное по площади оперение по образцу Ju 188, нижняя гондола была снята, а справа под фюзеляжем был установлен 'ваффентрофен' по образцу Ju 88С-5. Опытный образец с этими доработками получил обозначение Ju 88 V58, а серия получила литеру 'G'. Новая модификация сменила на сборочных линиях Ju 88С-6 весной 1944 г, а поступила в группы 'ночников' в начале лета.
Шла работа и по дневному варианту Ju 88С. В конце 1943 г появился 'охотник' Ju 88С-7а. На нем нижняя гондола была заменена на 'ваффентрофен' с теми же 20-мм пушками MG FF/M, выступавшими из переднего бомбоотсе-ка, а в заднем можно было подвесить до 500 кг бомб. В носу фюзеляжа устанавливались три пулемета MG 17 и одна пушка MG FF/M. Двигатели были Jumo 211J-1 или J-2. Ju 88C-7b получил дополнительно подкрыльевые держатели, что позволило увеличить бомбовую нагрузку до 1500 кг. Ju 88С-7с был опытным 'охотником' под двигатели BMW 801 MA без бомбодержателей и с заменой пушек MG FF/M на MG 151.
Хотя в течение 1944 г постоянно рассматривались планы сворачивания производства Ju 88, комплекс в Бернбурге был значительно расширен. В течение года люфтваффе приняли 3013 Ju 88 всех типов (2345 из Бернбурга), из которых почти все (более 2500) были истребители. Большинство из истребителей были модификации Ju 88С-6. Когда в конце лета 1944 г в серию пошел Ju 88G, ежемесячный выпуск уже упал. Таким образом в люфтваффе попало только 700-800 истребителей Ju 88G по сравнению с 3200 Ju 88С.
Хотя пик эффективности ночных истребителей был достигнут весной 1944 г. и они составляли 15% всей боевой авиации, их потенциал резко упал. С высадкой союзников во Франции образовался разрыв в радиолокационной сети обнаружения, и время предупреждения о налетах резко сократилось. Если авиапромышленность хорошо справлялась с восполнением потерь, то подготовка экипажей ночников оказалась более сложным делом. Наступление Красной Армии заставило перебросить часть полков ночных истребителей на Восточный фронт, где они использовались днем в качестве штурмовиков, а серьезные перебои с топливом осенью 1944 г ограничили использование оставшихся групп. В результате эффективность ночных истребителей снизилась.
10 января 1945 г Ju 88 использовались в группах ночных истребителей воздушного флота 'Рейх': I, II, III и IV/NJG 2, II, III и IV/NJG 3, I, II и III/ NJG 4, II/NJG 6 и II/NJG 100. Кроме того Ju 88 имела NJGr 10, а II, III и IV/